122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0736 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0736  Bacterial RNase P class A  100 
 
 		 288 bp  571  1e-161  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0080    100 
 
 		 295 bp  69.9  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00404274  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0019  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 297 bp  65.9  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000680683  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0053  RNase P  97.14 
 
 		 326 bp  61.9  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GsrnpB1  sRNA  97.06 
 
 		 315 bp  60  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0059    97.06 
 
 		 330 bp  60  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0003  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 327 bp  60  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0034  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 284 bp  60  0.0000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0012  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 356 bp  60  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0591334 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0003  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 315 bp  60  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0012  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 357 bp  60  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0035  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 363 bp  58  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.531572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0039  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 328 bp  58  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.652207 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0037  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 323 bp  58  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.742854  normal  0.0345695 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0015  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 313 bp  58  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0681345  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0033  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 332 bp  58  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562795  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0043  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 213 bp  58  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000487494  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0016  RNA component of RNaseP  94.44 
 
 		 329 bp  56  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0972  sRNA  94.44 
 
 		 292 bp  56  0.000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0052  RNA component of RNaseP  94.44 
 
 		 355 bp  56  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0053  RnaseP RNA  94.44 
 
 		 302 bp  56  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651902  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0007    94.44 
 
 		 344 bp  56  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.877668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0003  RNA component of RNaseP  94.44 
 
 		 305 bp  56  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135716  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_DernpB1  sRNA  94.29 
 
 		 261 bp  54  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.573184  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_McrnpB1  sRNA  94.29 
 
 		 359 bp  54  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5661  RNaseP_bact_a  94.29 
 
 		 293 bp  54  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00231772  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA62  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 292 bp  54  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0049  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 386 bp  54  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.653302  normal  0.250597 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R74  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 291 bp  54  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0499712 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0022  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 369 bp  54  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00496302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55190  RNase P RNA component precursor RnpB  94.29 
 
 		 296 bp  54  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0014  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 342 bp  54  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0007  bacterial RNase P  94.29 
 
 		 294 bp  54  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.365172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0006  RNAse P  94.29 
 
 		 304 bp  54  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.161973  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0088  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 295 bp  54  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.338139 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0033  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 272 bp  54  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399314  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0092  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 295 bp  54  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.347533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0011    94.29 
 
 		 295 bp  54  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0003  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 294 bp  54  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.158613 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0216  sRNA  94.29 
 
 		 346 bp  54  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0217  Bacterial RNase P class A  94.29 
 
 		 294 bp  54  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235788  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WprnpB1  WprnpB1  94.12 
 
 		 292 bp  52  0.00009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0028  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 366 bp  52  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0061  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 418 bp  52  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0246154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0068  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 372 bp  52  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.415959  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0030  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 369 bp  52  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.541777 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0035  RNase P RNA  94.12 
 
 		 354 bp  52  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_miscRNA10  RNaseP  94.12 
 
 		 365 bp  52  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133459  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0040  RNA component of RNaseP  92.11 
 
 		 360 bp  52  0.00009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.26217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0059  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 374 bp  52  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.303106  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0081  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 327 bp  52  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000487507  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0042  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 301 bp  50.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.293311  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0056  RNase P class A  93.94 
 
 		 276 bp  50.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.441573  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0032  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 326 bp  50.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0017  RNA component of RNaseP  91.89 
 
 		 307 bp  50.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0316864  normal  0.356279 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0043    93.94 
 
 		 303 bp  50.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.15761  hitchhiker  0.00179895 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0012  RNA component of RNaseP  91.67 
 
 		 301 bp  48.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpps01    91.67 
 
 		 205 bp  48.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpls01    91.67 
 
 		 205 bp  48.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0007  RNA component of RNaseP  96.43 
 
 		 390 bp  48.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.390255  normal  0.448753 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0036  RNA component of RNaseP  91.67 
 
 		 287 bp  48.1  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0013  RNA component of RNaseP  91.67 
 
 		 303 bp  48.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.603572  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0031  RNA component of RNaseP  91.67 
 
 		 347 bp  48.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0032  RNA component of RNaseP  91.67 
 
 		 333 bp  48.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.148898 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1157  sRNA  91.67 
 
 		 287 bp  48.1  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0068  RNA component of RNaseP  91.67 
 
 		 350 bp  48.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000826287  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0006  RNA component of RNaseP  91.67 
 
 		 347 bp  48.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0741238  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0048  RNA component of RNaseP  91.67 
 
 		 298 bp  48.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0023  RNA component of RNaseP  91.67 
 
 		 304 bp  48.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000192247  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0022  RNaseP RNA  91.67 
 
 		 347 bp  48.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00017502  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0083  RNA component of RNaseP  91.67 
 
 		 301 bp  48.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.481467  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0055  RNase P  93.75 
 
 		 338 bp  48.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0010  RNA component of RNaseP  91.67 
 
 		 317 bp  48.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0451963  hitchhiker  0.000582152 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4302  RNase P class A  91.67 
 
 		 303 bp  48.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0051  RNA component of RNaseP  93.75 
 
 		 295 bp  48.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.90798  normal  0.258556 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4778  RNase P, class A  91.67 
 
 		 301 bp  48.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0076  RNA component of RNaseP  91.67 
 
 		 303 bp  48.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0093  RNA component of RNaseP  91.67 
 
 		 303 bp  48.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.963867  normal  0.310473 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0028  RNA component of RNaseP  91.67 
 
 		 270 bp  48.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0063  RNA component of RNaseP  91.67 
 
 		 347 bp  48.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.927439 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4220  bacterial RNase P, class A  91.67 
 
 		 303 bp  48.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0014    91.67 
 
 		 301 bp  48.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0023    91.67 
 
 		 347 bp  48.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000610134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0023    91.67 
 
 		 347 bp  48.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000569795  normal  0.573618 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0009    91.67 
 
 		 350 bp  48.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000711209  normal  0.574363 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0014  RNA component of RNaseP  91.67 
 
 		 303 bp  48.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4977  Bacterial RNase P class A  91.67 
 
 		 301 bp  48.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3508  Bacterial RNase P class A  91.67 
 
 		 301 bp  48.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3544  Bacterial RNase P class A  91.67 
 
 		 301 bp  48.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.285597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3439  Bacterial RNase P class A  91.67 
 
 		 301 bp  48.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3436  Bacterial RNase P class A  91.67 
 
 		 301 bp  48.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3605  Bacterial RNase P class A  91.67 
 
 		 301 bp  48.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.976853 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4435  Bacterial RNase P class A  91.67 
 
 		 301 bp  48.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0846372 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0034  RNA component of RNaseP  91.67 
 
 		 333 bp  48.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0944967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0056  RNA component of RNaseP  91.67 
 
 		 335 bp  48.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.425167 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0024  RNA component of RNase P  91.43 
 
 		 349 bp  46.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.699982  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0006  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 305 bp  46.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0064  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 316 bp  46.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0444698  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1398  sRNA  91.43 
 
 		 422 bp  46.1  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0029  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 364 bp  46.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.830354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>