21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_R0028 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_R0028  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 270 bp  535  1e-150  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0056  RNase P class A  88.98 
 
 		 276 bp  133  3e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.441573  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0033  RNA component of RNaseP  97.3 
 
 		 272 bp  65.9  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399314  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0068  RNA component of RNaseP  97.14 
 
 		 372 bp  61.9  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.415959  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0059    96.97 
 
 		 330 bp  58  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0037  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 323 bp  58  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.742854  normal  0.0345695 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0035  RNA component of RNaseP  96.88 
 
 		 363 bp  56  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.531572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0033  RNA component of RNaseP  96.88 
 
 		 332 bp  56  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562795  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0039  RNA component of RNaseP  96.88 
 
 		 328 bp  56  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.652207 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0043  RNA component of RNaseP  96.88 
 
 		 213 bp  56  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000487494  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0005  RNase P class A  86.36 
 
 		 280 bp  56  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0015  RNA component of RNaseP  96.88 
 
 		 313 bp  56  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0681345  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0005  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 280 bp  54  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.500328  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0080    92.31 
 
 		 295 bp  54  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00404274  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1797  bacterial RNase P, class A  96.55 
 
 		 380 bp  50.1  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.848087  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0018    93.75 
 
 		 358 bp  48.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000656254  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0736  Bacterial RNase P class A  91.67 
 
 		 288 bp  48.1  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0019  RNA component of RNaseP  93.75 
 
 		 297 bp  48.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000680683  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0038  RNA component of RNaseP  91.67 
 
 		 294 bp  48.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0147775  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0067  RNA component of RNaseP  91.67 
 
 		 398 bp  48.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.742746  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0034  RNA component of RNaseP  93.75 
 
 		 284 bp  48.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>