31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_r0013 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_r0013  RNA_RNaseP_classA  100 
 
 		 313 bp  620  1e-176  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.336548  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1382  Bacterial RNase P class A  88.13 
 
 		 312 bp  270  2e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12130  Bacterial RNase P class A  91.94 
 
 		 317 bp  75.8  0.000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0161879  normal  0.0949657 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0045  RNA component of RNaseP  83.33 
 
 		 312 bp  71.9  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0036  rnpB RNA  100 
 
 		 337 bp  67.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0407742  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0025  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 184 bp  65.9  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0034  RNA component of RNaseP  88.24 
 
 		 306 bp  63.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0026  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 326 bp  60  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.344624 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0027  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 326 bp  58  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0021  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 328 bp  58  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.584504  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0048  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 333 bp  58  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.231595 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15110  Bacterial RNase P class A  96.97 
 
 		 324 bp  58  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0022  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 345 bp  58  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0068  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 338 bp  58  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.400378  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0097  RNA component of RNaseP  89.8 
 
 		 346 bp  58  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0051  RNA component of RNaseP  96.88 
 
 		 345 bp  56  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000384072  normal  0.735401 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0037  RNaseP RNA  96.88 
 
 		 347 bp  56  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0059  RNA component of RNaseP  96.88 
 
 		 343 bp  56  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0109691  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07210  bacterial RNase P class A  94.29 
 
 		 340 bp  54  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0034  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 339 bp  52  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0035  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 334 bp  52  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0038  RNA component of RNaseP  96.55 
 
 		 348 bp  50.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000786849  hitchhiker  0.000162331 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0038  RNA component of RNaseP  96.55 
 
 		 354 bp  50.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0631532  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0039  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 341 bp  50.1  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0961177  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0037  RNA component of RNaseP  85.51 
 
 		 356 bp  50.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0037  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 316 bp  50.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.353457  normal  0.717532 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09520  Bacterial RNase P class A  93.94 
 
 		 325 bp  50.1  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.546213  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0056  RNaseP RNA  91.43 
 
 		 301 bp  46.1  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0007  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 373 bp  46.1  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0039  RNA component of RNaseP  87.23 
 
 		 353 bp  46.1  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.835147  hitchhiker  0.000446609 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0014  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 308 bp  46.1  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479029 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>