28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_R0020 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_R0020  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 336 bp  666    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00784007  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0034  RNA component of RNaseP  91.3 
 
 		 284 bp  60  0.0000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0029  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 318 bp  58  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.223186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0026  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 352 bp  58  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0030  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 369 bp  58  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.541777 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0026    100 
 
 		 352 bp  58  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112787  normal  0.29331 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0035  RNase P RNA  100 
 
 		 354 bp  58  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0021  RNA component of RNaseP  91.89 
 
 		 328 bp  50.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.584504  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0046  RNA component of RNaseP  96.55 
 
 		 427 bp  50.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0219533  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0022  RNA component of RNaseP  91.67 
 
 		 345 bp  48.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0048  RNA component of RNaseP  96.43 
 
 		 298 bp  48.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09520  Bacterial RNase P class A  91.67 
 
 		 325 bp  48.1  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.546213  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0045  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 312 bp  46.1  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0217  Bacterial RNase P class A  96.3 
 
 		 294 bp  46.1  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235788  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0029  RNA component of RNaseP  96.3 
 
 		 298 bp  46.1  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.538332  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15110  Bacterial RNase P class A  91.43 
 
 		 324 bp  46.1  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0048  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 333 bp  46.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.231595 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0034  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 339 bp  46.1  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0027  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 326 bp  46.1  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07210  bacterial RNase P class A  91.43 
 
 		 340 bp  46.1  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0034  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 306 bp  46.1  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_McrnpB1  sRNA  96.3 
 
 		 359 bp  46.1  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0216  sRNA  96.3 
 
 		 346 bp  46.1  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0003  RNA component of RNaseP  96.3 
 
 		 294 bp  46.1  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.158613 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0040  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 360 bp  46.1  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.26217 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0068  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 338 bp  46.1  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.400378  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpls01    96.3 
 
 		 205 bp  46.1  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpps01    96.3 
 
 		 205 bp  46.1  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>