42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_R0040 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_R0040  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 360 bp  714    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.26217 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0033  RNA component of RNaseP  89.86 
 
 		 304 bp  67.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.256591  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0007    97.22 
 
 		 344 bp  63.9  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.877668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0042  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 301 bp  58  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.293311  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0034  RNA component of RNaseP  86.76 
 
 		 333 bp  58  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0944967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0032  RNA component of RNaseP  86.76 
 
 		 333 bp  58  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.148898 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4508  RNase P RNA component precursor RnpB  89.58 
 
 		 396 bp  56  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1398  sRNA  94.29 
 
 		 422 bp  54  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0029  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 364 bp  54  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.830354  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0007  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 390 bp  54  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.390255  normal  0.448753 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0736  Bacterial RNase P class A  92.11 
 
 		 288 bp  52  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0027  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 285 bp  52  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0034  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 333 bp  52  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0634985 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0014  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 308 bp  50.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479029 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0071  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 338 bp  50.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0880759  normal  0.202054 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0007  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 373 bp  50.1  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0039  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 353 bp  50.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.835147  hitchhiker  0.000446609 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0037  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 356 bp  50.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0056  RNaseP RNA  93.94 
 
 		 301 bp  50.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0053  RnaseP RNA  91.67 
 
 		 302 bp  48.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651902  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0052  RNA component of RNaseP  91.67 
 
 		 355 bp  48.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0972  sRNA  91.67 
 
 		 292 bp  48.1  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0003  RNA component of RNaseP  91.67 
 
 		 305 bp  48.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135716  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0216  sRNA  91.43 
 
 		 346 bp  46.1  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_McrnpB1  sRNA  91.43 
 
 		 359 bp  46.1  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WprnpB1  WprnpB1  91.43 
 
 		 292 bp  46.1  0.007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0020  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 336 bp  46.1  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00784007  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5661  RNaseP_bact_a  91.43 
 
 		 293 bp  46.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00231772  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA62  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 292 bp  46.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0049  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 386 bp  46.1  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.653302  normal  0.250597 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R74  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 291 bp  46.1  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0499712 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55190  RNase P RNA component precursor RnpB  91.43 
 
 		 296 bp  46.1  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0022  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 369 bp  46.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00496302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0217  Bacterial RNase P class A  91.43 
 
 		 294 bp  46.1  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235788  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0007  bacterial RNase P  91.43 
 
 		 294 bp  46.1  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.365172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0014  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 342 bp  46.1  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0003  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 294 bp  46.1  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.158613 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0035  RNaseP RNA  91.43 
 
 		 378 bp  46.1  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0011    91.43 
 
 		 295 bp  46.1  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0092  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 295 bp  46.1  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.347533  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_rnpB  RNase P RNA component  91.43 
 
 		 326 bp  46.1  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0088  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 295 bp  46.1  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.338139 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>