18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ecaj_R0036 on replicon NC_007354
Organism: Ehrlichia canis str. Jake



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007354  Ecaj_R0036  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 287 bp  569  1e-160  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1157  sRNA  93.75 
 
 		 287 bp  412  1e-113  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WprnpB1  WprnpB1  83.7 
 
 		 292 bp  83.8  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0038  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 284 bp  52  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2222  bacterial RNase P, class A  93.94 
 
 		 292 bp  50.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5661  RNaseP_bact_a  87.5 
 
 		 293 bp  48.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00231772  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0736  Bacterial RNase P class A  91.67 
 
 		 288 bp  48.1  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0011    87.5 
 
 		 295 bp  48.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0092  RNA component of RNaseP  87.5 
 
 		 295 bp  48.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.347533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R74  RNA component of RNaseP  87.5 
 
 		 291 bp  48.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0499712 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0053  RnaseP RNA  91.43 
 
 		 302 bp  46.1  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651902  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0014  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 342 bp  46.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0052  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 355 bp  46.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0972  sRNA  91.43 
 
 		 292 bp  46.1  0.005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0007    91.43 
 
 		 344 bp  46.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.877668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0080    91.43 
 
 		 295 bp  46.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00404274  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0003  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 305 bp  46.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135716  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0016  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 329 bp  46.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>