More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1736 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1736  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 
245 aa  499  1e-140  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000179843  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2521  protein translocase subunit yidC  33.96 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0677656  hitchhiker  0.0000441825 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2760  60 kDa inner membrane insertion protein  32 
 
 
341 aa  109  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644122  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  33.8 
 
 
223 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4312  60 kDa inner membrane insertion protein  32.33 
 
 
543 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.301696  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2314  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.57 
 
 
565 aa  97.1  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2224  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.29 
 
 
565 aa  97.4  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.176857  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0550  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.49 
 
 
526 aa  97.1  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.19 
 
 
541 aa  96.7  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0881  60 kDa inner membrane insertion protein  32.26 
 
 
514 aa  96.7  3e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1427  60 kDa inner membrane insertion protein  27.23 
 
 
345 aa  96.3  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.739034  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0237  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.91 
 
 
596 aa  96.3  4e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.24 
 
 
532 aa  95.9  5e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2235  60 kDa inner membrane insertion protein  29.17 
 
 
300 aa  94.7  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.971455  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.23 
 
 
541 aa  94.7  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  30.95 
 
 
541 aa  94  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2149  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  32.73 
 
 
231 aa  94  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  30.48 
 
 
541 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0009  inner membrane protein, 60 kDa  31.43 
 
 
541 aa  93.6  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000942032  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1263  60 kDa inner membrane insertion protein  31.11 
 
 
531 aa  93.2  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00209254  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  28.77 
 
 
536 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  32.69 
 
 
532 aa  93.2  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3431  OxaA-like protein precursor  30.26 
 
 
256 aa  93.2  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000222653  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  31.43 
 
 
541 aa  92.8  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  30.48 
 
 
541 aa  93.2  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  31.43 
 
 
541 aa  92.8  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  31.43 
 
 
541 aa  93.2  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  31.43 
 
 
541 aa  92.8  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3965  60 kDa inner membrane insertion protein  26.54 
 
 
330 aa  93.2  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255718  normal  0.0997602 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2932  60 kDa inner membrane insertion protein  28.98 
 
 
213 aa  92.4  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000772095  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0764  60 kDa inner membrane insertion protein  33 
 
 
311 aa  92.8  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.105413  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  30 
 
 
541 aa  92.8  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  30 
 
 
541 aa  92.4  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.46 
 
 
530 aa  92  7e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2629  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  30.29 
 
 
249 aa  92  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  30.48 
 
 
545 aa  92  7e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  28.38 
 
 
553 aa  92  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  30.95 
 
 
542 aa  92  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4176  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.27 
 
 
548 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  30 
 
 
541 aa  92  8e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5339  OxaA-like protein precursor  31.68 
 
 
255 aa  92  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5167  OxaA-like protein precursor  31.68 
 
 
255 aa  92  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000191232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5183  OxaA-like protein precursor  31.68 
 
 
255 aa  92  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000628839  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5322  OxaA-like protein precursor  30.8 
 
 
255 aa  91.7  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.409244 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5736  OxaA-like protein precursor  31.68 
 
 
255 aa  92  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.557445  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.46 
 
 
530 aa  91.7  9e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2322  60 kDa inner membrane insertion protein  31.38 
 
 
246 aa  91.7  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5596  OxaA-like protein precursor  31.68 
 
 
255 aa  92  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.66 
 
 
540 aa  91.7  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.29 
 
 
517 aa  91.3  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1537  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  30.69 
 
 
454 aa  91.3  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000836687  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3775  60 kDa inner membrane insertion protein  31.43 
 
 
541 aa  91.3  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000106175  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4054  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.86 
 
 
548 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0899835  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  30.48 
 
 
540 aa  90.9  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4135  60 kDa inner membrane insertion protein  30.39 
 
 
219 aa  90.9  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.251596  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0002  60 kDa inner membrane insertion protein  30 
 
 
544 aa  90.9  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000135714  unclonable  0.000000000155498 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4126  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.86 
 
 
548 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.222064  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08476  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.36 
 
 
622 aa  90.9  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.98 
 
 
531 aa  90.5  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0079  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.91 
 
 
597 aa  90.5  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.08 
 
 
546 aa  90.1  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1536  60 kDa inner membrane insertion protein  30.77 
 
 
252 aa  90.1  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0046274  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.86 
 
 
548 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0448  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.57 
 
 
544 aa  90.1  3e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  26.29 
 
 
539 aa  90.1  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4069  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.86 
 
 
548 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00340238  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.08 
 
 
546 aa  90.1  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.08 
 
 
546 aa  90.1  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03589  inner membrane protein translocase component YidC  26.45 
 
 
548 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  26.45 
 
 
548 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4220  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.45 
 
 
548 aa  89.7  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4289  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.45 
 
 
548 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0759973  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4072  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.45 
 
 
548 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131417  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4215  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.45 
 
 
548 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4026  OxaA-like protein precursor  31.68 
 
 
255 aa  89.4  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.677321  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5135  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.45 
 
 
548 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00207092  normal  0.0616185 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3919  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.45 
 
 
548 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00313921  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03533  hypothetical protein  26.45 
 
 
548 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0976  60 kDa inner membrane insertion protein  30 
 
 
515 aa  89.4  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000560326  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4929  60 kDa inner membrane insertion protein  30.48 
 
 
544 aa  89.4  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000771873  unclonable  0.00000001353 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5279  OxaA-like protein precursor  31.19 
 
 
255 aa  89.4  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  29.82 
 
 
566 aa  89  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.35 
 
 
581 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.64 
 
 
557 aa  88.6  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.45 
 
 
545 aa  88.6  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0158  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.65 
 
 
621 aa  88.6  9e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.413762  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5637  OxaA-like protein precursor  31.19 
 
 
255 aa  88.6  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.951297  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5613  OxaA-like protein precursor  31.19 
 
 
258 aa  88.6  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.12 
 
 
558 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.12 
 
 
558 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  26.13 
 
 
542 aa  88.2  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.57 
 
 
607 aa  87.8  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.12 
 
 
558 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.12 
 
 
558 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4149  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.03 
 
 
548 aa  88.2  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000105437  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5176  OxaA-like protein precursor  29.17 
 
 
260 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.12 
 
 
558 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.12 
 
 
558 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5673  OxaA-like protein precursor  30.69 
 
 
255 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.12 
 
 
558 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>