More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1399 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1399  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  100 
 
 
422 aa  810    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.235617  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2554  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  84.67 
 
 
407 aa  629  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.149279  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2458  putative sigma54 specific transcriptional regulator  83.7 
 
 
407 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209085  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1305  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  44.95 
 
 
379 aa  295  9e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.314792  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0471  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  57.32 
 
 
349 aa  280  5e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0982753 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06173  transcriptional regulator  45.19 
 
 
494 aa  278  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.97776  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00993  transcriptional regulator  45.19 
 
 
494 aa  278  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.656224  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1446  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  41.99 
 
 
366 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.396101  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1973  response regulator receiver protein  44.21 
 
 
491 aa  274  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1883  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  46.03 
 
 
501 aa  271  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.725462 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1324  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  56.38 
 
 
350 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.02567 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2362  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  42.67 
 
 
479 aa  268  2e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2959  Fis family transcriptional regulator  55.97 
 
 
341 aa  268  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2312  sigma 54 dependent transcription regulator  41.48 
 
 
493 aa  268  2e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0915  transcriptional regulator FleQ  56.52 
 
 
471 aa  267  2.9999999999999995e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0884  transcriptional regulator FleQ  56.52 
 
 
471 aa  267  2.9999999999999995e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0431  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  45.93 
 
 
489 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462878  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1208  two component signal transduction response regulator  54.8 
 
 
470 aa  264  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0354694  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3940  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  51.79 
 
 
467 aa  261  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000637809  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1320  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  55.24 
 
 
460 aa  261  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3232  flagellar regulatory protein A  39.36 
 
 
477 aa  261  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2442  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  53.97 
 
 
480 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1278  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  39.36 
 
 
477 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.71706 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1326  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  54.37 
 
 
485 aa  260  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2629  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  54.37 
 
 
483 aa  260  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.14604  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1345  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  39.36 
 
 
477 aa  260  3e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4024  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  51.79 
 
 
467 aa  260  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42797e-16 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1338  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  39.6 
 
 
477 aa  260  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0526886  normal  0.316977 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1721  flagellar regulatory protein A  41.05 
 
 
488 aa  259  5.0000000000000005e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000009386  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2001  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  42.44 
 
 
482 aa  259  5.0000000000000005e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2533  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  53.97 
 
 
483 aa  259  7e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4389  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  50.35 
 
 
495 aa  259  8e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205713  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0197  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  40.42 
 
 
1098 aa  259  9e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.793641  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1129  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  51.42 
 
 
453 aa  258  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3749  Sigma 54 interacting domain protein  51.42 
 
 
596 aa  258  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.552068  normal  0.248061 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2580  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  39.36 
 
 
477 aa  258  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2812  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  53.91 
 
 
466 aa  258  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2521  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  47.04 
 
 
457 aa  258  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3226  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  53.5 
 
 
335 aa  256  5e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1510  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  47.69 
 
 
448 aa  256  5e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1908  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  48.62 
 
 
473 aa  256  5e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3765  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  49.8 
 
 
463 aa  256  6e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000821276  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2453  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  52.63 
 
 
461 aa  256  7e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000196128  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1032  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  55.23 
 
 
461 aa  256  7e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.454426 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3740  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  53.17 
 
 
454 aa  255  8e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0840186  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2056  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  48.62 
 
 
473 aa  255  9e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.732718  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2940  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  39.17 
 
 
477 aa  255  9e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.568996  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2930  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  39.17 
 
 
477 aa  255  9e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.549756  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3072  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  39.17 
 
 
477 aa  255  9e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.584098  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1433  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  39.17 
 
 
477 aa  255  9e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1971  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  48.62 
 
 
473 aa  255  9e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0887215  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1698  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  46.69 
 
 
457 aa  255  9e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000740904 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3475  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  54.81 
 
 
453 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0804749 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5989  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  53.04 
 
 
459 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.999422  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3076  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  50.56 
 
 
454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002811  flagellar regulatory protein FleQ  39.68 
 
 
488 aa  255  1.0000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2194  response regulator receiver domain-containing protein  55.27 
 
 
479 aa  255  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0853  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  47.7 
 
 
502 aa  255  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1362  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  39.11 
 
 
477 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3263  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  48.54 
 
 
464 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000257125 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5338  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  53.57 
 
 
462 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2984  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  51.01 
 
 
458 aa  253  3e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.826768  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0670  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  51.39 
 
 
464 aa  254  3e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3070  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  38.86 
 
 
477 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0097  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  50.78 
 
 
448 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0501  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  55.36 
 
 
466 aa  253  5.000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1496  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  53.1 
 
 
451 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.190196  normal  0.699272 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0776  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  52.42 
 
 
454 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0568  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  53.12 
 
 
489 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1498  flagellar regulatory protein A  39.09 
 
 
509 aa  253  6e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.522741  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0789  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  48.15 
 
 
448 aa  253  6e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0827  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  57.51 
 
 
460 aa  253  6e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2893  transcriptional regulator, Fis family  56.28 
 
 
630 aa  252  7e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.359739 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3051  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  49.43 
 
 
477 aa  252  7e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2639  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  49.6 
 
 
553 aa  252  7e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.017271  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1287  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  50 
 
 
452 aa  252  8.000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.541874  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4371  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  52.33 
 
 
451 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109269  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2596  sigma-54-dependent transcriptional activator  50.83 
 
 
553 aa  251  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.491073  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3413  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  53.97 
 
 
453 aa  252  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0673  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  55.42 
 
 
457 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1357  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  38.61 
 
 
477 aa  251  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.569936  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1300  putative phytochrome sensor protein  47.96 
 
 
518 aa  252  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2345  two component signal transduction response regulator  48.11 
 
 
455 aa  251  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00459366  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3599  two component Fis family transcriptional regulator  51.98 
 
 
459 aa  251  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2092  NifA subfamily transcriptional regulator  51.38 
 
 
606 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.103572 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4240  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  54.4 
 
 
469 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0884  NifA subfamily transcriptional regulator  50.81 
 
 
539 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.871675 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2770  PAS sensor protein  55.02 
 
 
629 aa  250  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2756  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  49.36 
 
 
462 aa  250  3e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4274  transcriptional regulator FleQ  43.58 
 
 
490 aa  251  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1614  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  38.61 
 
 
477 aa  250  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1388  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  51.64 
 
 
463 aa  250  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0597975 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50220  transcriptional regulator FleQ  43.58 
 
 
490 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000359147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3932  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  52.96 
 
 
451 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.215439  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4373  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  54.4 
 
 
469 aa  250  4e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0673  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  55.02 
 
 
458 aa  250  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1385  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  56.33 
 
 
460 aa  250  4e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4396  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  54.4 
 
 
469 aa  250  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2997  putative PAS/PAC sensor protein  55.06 
 
 
629 aa  250  4e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.127618 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1951  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.7 
 
 
470 aa  250  4e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.516267  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>