More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0028 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_0028  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 313 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0043  transcriptional regulator, LysR family  94.3 
 
 		 312 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0031  transcriptional regulator, LysR family  94.3 
 
 		 312 aa  498  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4420  transcriptional regulator, LysR family  47.96 
 
 		 316 aa  230  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.395777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5946  transcriptional regulator LysR family  33.22 
 
 		 312 aa  142  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0372  transcriptional regulator, LysR family  39.33 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103497  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1039  transcriptional regulator, LysR family  41.14 
 
 		 311 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0343  LysR family transcriptional regulator  39 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294854  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0977  LysR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.465087  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0359  transcriptional regulator, LysR family  38.67 
 
 		 313 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0121795  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2895  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.521914  normal  0.0431936 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1512  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 307 aa  133  3.9999999999999996e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.607249  normal  0.542943 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7466  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 290 aa  132  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3832  LysR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 290 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.524021 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5026  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111623  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5834  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2367  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 294 aa  130  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4282  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.352562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4345  LysR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 315 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2169  transcriptional regulator, LysR family  32.56 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3045  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54605 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3528  transcriptional regulator, LysR family  37.06 
 
 		 298 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0086237 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3893  LysR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.811179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0722  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1441  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 322 aa  126  6e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3202  transcriptional regulator, LysR family  36.71 
 
 		 298 aa  125  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6141  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 290 aa  125  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1750  transcriptional regulator, LysR family  31.38 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.286779  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2448  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3293  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 301 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185242  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49680  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 291 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1155  LysR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 304 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0046037  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0798  LysR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.748427  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1979  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00673932 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1898  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2557  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.748722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3491  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155572  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2844  transcriptional regulator, LysR family  31.68 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.223887  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0997  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 315 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3448  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2721  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 322 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4291  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1371  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4075  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0825  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 303 aa  119  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2523  transcriptional regulator, LysR family  33.78 
 
 		 300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2577  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4540  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 339 aa  119  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0590293  normal  0.826937 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5963  transcriptional regulator, LysR family  34.49 
 
 		 297 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0185947 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0688  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27.52 
 
 		 315 aa  119  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2194  LysR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.569492 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2010  LysR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1954  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3487  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5996  transcriptional regulator, LysR family  35.99 
 
 		 296 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0861093  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3188  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.708036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2937  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1199  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 313 aa  116  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2242  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163141  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4478  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 297 aa  116  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.515823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1335  LysR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 290 aa  116  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1814  transcriptional regulator, LysR family  32.39 
 
 		 303 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0840  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 288 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01990  transcriptional regulator transcription regulator protein  35.62 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3476  LysR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0142034 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0876  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5772  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189164  normal  0.699702 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0127  LysR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0555  transcriptional regulator LysR family  32.99 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4317  LysR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4514  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.973008 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4049  LysR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0950657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2728  transcriptional regulator, LysR family  32.87 
 
 		 299 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0937  LysR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 332 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3700  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 306 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4668  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 306 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35051  normal  0.639352 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4279  LysR substrate-binding  34.86 
 
 		 334 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1036  transcriptional regulator, LysR family  37.46 
 
 		 294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3705  LysR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217893  normal  0.044305 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1705  transcriptional regulator, LysR family  38.16 
 
 		 302 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368943  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4928  LysR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 307 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.595965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4581  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 298 aa  112  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.325536 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3334  transcription regulator protein  34.27 
 
 		 298 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3213  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 294 aa  112  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.772963  normal  0.565798 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2989  transcriptional regulator, LysR family  32.87 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0878749 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2478  LysR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.585884  normal  0.517095 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3247  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0242  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 318 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0881  LysR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0619  LysR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.415419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3944  transcriptional regulator, LysR family  32.77 
 
 		 296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0694  LysR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 329 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3433  transcriptional regulator LysR family  33.92 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2031  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.810813  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6740  transcriptional regulator, LysR family  28.25 
 
 		 317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1632  transcriptional regulator, LysR family  39.93 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0649  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 301 aa  109  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.33789 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3868  transcriptional regulator, LysR family  30.61 
 
 		 315 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1089  LysR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 300 aa  108  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>