284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1576 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1576  ribosomal protein S20  100 
 
 		 89 aa  170  5.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  59.26 
 
 		 105 aa  85.9  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  58.54 
 
 		 95 aa  85.1  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  55 
 
 		 88 aa  84.7  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  56.25 
 
 		 94 aa  84.3  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  51.85 
 
 		 88 aa  83.6  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  59.76 
 
 		 88 aa  82.8  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  51.85 
 
 		 115 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000562255  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  55.42 
 
 		 88 aa  81.3  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  52.5 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  52.5 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4315  30S ribosomal protein S20  46.15 
 
 		 90 aa  72  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000159944  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  56 
 
 		 95 aa  71.2  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  54.05 
 
 		 90 aa  70.9  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  48.78 
 
 		 85 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  54.55 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  53.16 
 
 		 89 aa  67.8  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  48.19 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  50.67 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  52.05 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  47.5 
 
 		 89 aa  64.7  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  48.75 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  48.75 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  47.19 
 
 		 89 aa  63.9  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0290  ribosomal protein S20  48.53 
 
 		 73 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000431613  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2725  30S ribosomal protein S20  47.3 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0313698  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  45 
 
 		 87 aa  62  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0647  30S ribosomal protein S20  43.59 
 
 		 84 aa  61.2  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000292559  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1261  30S ribosomal protein S20  48.31 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1583  30S ribosomal protein S20  43.42 
 
 		 83 aa  61.2  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.74402  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2909  30S ribosomal protein S20  45.95 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  46.91 
 
 		 86 aa  60.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2817  30S ribosomal protein S20  45.95 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1019  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1919  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000179184  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  45.78 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  46.67 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  46.67 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  43.59 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  46.67 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3262  ribosomal protein S20  50.67 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521997  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  44.59 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0947  ribosomal protein S20  47.5 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  46.34 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  43.75 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3191  ribosomal protein S20  50.79 
 
 		 68 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00000247507  normal  0.0669339 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2436  ribosomal protein S20  46.34 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000012228  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1520  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2297  30S ribosomal protein S20  47.5 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1587  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  37.5 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2941  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.205918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  43.9 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0490  ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  41.98 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4514  30S ribosomal protein S20  45.21 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1780  30S ribosomal protein S20  45.12 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  44.19 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  43.21 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  44 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1753  30S ribosomal protein S20  45.12 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12640  SSU ribosomal protein S20P  45 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.464272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0001  ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0152754  hitchhiker  4.7444199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6963  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2301  ribosomal protein S20  39.02 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 87 aa  53.5  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3922  30S ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1281  30S ribosomal protein S20  45.12 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000755686  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0850  30S ribosomal protein S20  44.16 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000116553  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3546  30S ribosomal protein S20  41.89 
 
 		 89 aa  53.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  43.75 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  42.67 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0950  30S ribosomal protein S20  44.16 
 
 		 77 aa  52.8  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0608659  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  39.74 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1416  30S ribosomal protein S20  42.5 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.719270000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0771  30S ribosomal protein S20  45.12 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1106  30S ribosomal protein S20  40.96 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00644283  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0756  30S ribosomal protein S20  45.12 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000125202  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0196  ribosomal protein S20  41.98 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  42.67 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0792  ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1134  30S ribosomal protein S20  42.68 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000567629  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1172  30S ribosomal protein S20  41.56 
 
 		 88 aa  51.6  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000575412  hitchhiker  0.00000000402538 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  41.03 
 
 		 86 aa  51.6  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  41.98 
 
 		 88 aa  51.2  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000591631  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1184  ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7677  30S ribosomal protein S20  45.57 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118438  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  40.24 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3570  30S ribosomal protein S20  45.95 
 
 		 103 aa  51.2  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4205  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.885045 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1517  SSU ribosomal protein S20P  47.95 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.256049  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1902  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000191113  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3551  30S ribosomal protein S20  44.59 
 
 		 89 aa  50.8  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0856  ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.819382  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0739  30S ribosomal protein S20  41.46 
 
 		 97 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2188  30S ribosomal protein S20  48.65 
 
 		 91 aa  50.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>