More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2972 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 94 aa  176  8e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  70.13 
 
 		 90 aa  99.4  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  55.17 
 
 		 88 aa  82  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  51.72 
 
 		 88 aa  77  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000591631  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0527  ribosomal protein S20  54.76 
 
 		 88 aa  76.6  0.00000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  53.66 
 
 		 94 aa  74.3  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3191  ribosomal protein S20  68.42 
 
 		 68 aa  73.9  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00000247507  normal  0.0669339 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  58.23 
 
 		 89 aa  73.6  0.0000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3551  30S ribosomal protein S20  48.31 
 
 		 89 aa  72.8  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  53.66 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0001  ribosomal protein S20  51.19 
 
 		 87 aa  70.9  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0152754  hitchhiker  4.7444199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  52.44 
 
 		 90 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  52.44 
 
 		 92 aa  69.3  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1019  30S ribosomal protein S20  45.74 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  51.85 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1576  ribosomal protein S20  51.76 
 
 		 89 aa  68.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1755  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 91 aa  68.6  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00299182  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0739  30S ribosomal protein S20  47.96 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4890  30S ribosomal protein S20  49.43 
 
 		 88 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.540354  normal  0.302297 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1018  30S ribosomal protein S20  44.21 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.859687  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18881  30S ribosomal protein S20  44.21 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.825907  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  51.22 
 
 		 89 aa  68.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1780  30S ribosomal protein S20  44.33 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1753  30S ribosomal protein S20  44.33 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0001  30S ribosomal protein S20  49.43 
 
 		 88 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.714217 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0001  30S ribosomal protein S20  49.43 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4205  30S ribosomal protein S20  48.39 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.885045 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  50.57 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0947  ribosomal protein S20  51.9 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  52.5 
 
 		 86 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2069  30S ribosomal protein S20  45.16 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  52.5 
 
 		 86 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  52.5 
 
 		 86 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0001  30S ribosomal protein S20  48.31 
 
 		 88 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0002  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 88 aa  66.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000000182845  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1846  30S ribosomal protein S20  46.15 
 
 		 91 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  53.66 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  53.66 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2941  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.205918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2188  30S ribosomal protein S20  46.15 
 
 		 91 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220995  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0603  30S ribosomal protein S20  43.01 
 
 		 98 aa  66.2  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0490  ribosomal protein S20  46.59 
 
 		 99 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  48.28 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  48.78 
 
 		 86 aa  65.5  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  53.25 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2185  30S ribosomal protein S20  48.81 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2098  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00199179  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1134  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000567629  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  50.65 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  48.75 
 
 		 115 aa  63.5  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000562255  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1520  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 98 aa  63.5  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  47.87 
 
 		 92 aa  63.5  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  49.37 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0696  ribosomal protein S20  50 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207001  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 86 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3079  SSU ribosomal protein S20P  44.94 
 
 		 88 aa  63.5  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0239933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 88 aa  63.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4514  30S ribosomal protein S20  43.82 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  45.78 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4233  ribosomal protein S20  48.31 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000543427  hitchhiker  0.000000915309 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7677  30S ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 88 aa  62  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118438  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  48.78 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1580  30S ribosomal protein S20  41.84 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04341  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  48.78 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16781  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 97 aa  62  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3922  30S ribosomal protein S20  48.75 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0907  30S ribosomal protein S20  47.44 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0700  ribosomal protein S20  46.15 
 
 		 92 aa  62  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000536683  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16911  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 97 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 86 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  46.67 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_002936  DET1639  30S ribosomal protein S20  51.22 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000663879  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  50 
 
 		 86 aa  61.6  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1521  ribosomal protein S20  51.22 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000787873  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16091  30S ribosomal protein S20  39.36 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0802  ribosomal protein S20  50.65 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.939654  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6963  30S ribosomal protein S20  49.37 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16671  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  46.34 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  46.91 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1383  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000140868  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4641  30S ribosomal protein S20  43.48 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647122  hitchhiker  0.00990259 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1013  30S ribosomal protein S20  48.81 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000773203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4370  30S ribosomal protein S20  43.48 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664055 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  48.05 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  48.78 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 84 aa  60.5  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000167926  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0416  30S ribosomal protein S20  46.07 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000443906  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1919  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000179184  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  46.91 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2689  30S ribosomal protein S20  48.31 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2561  30S ribosomal protein S20  48.31 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1487  30S ribosomal protein S20  48.1 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.422821  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2725  30S ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0313698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>