More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7071 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  100 
 
 		 88 aa  167  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  79.07 
 
 		 86 aa  124  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  77.91 
 
 		 86 aa  123  7e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  74.42 
 
 		 86 aa  122  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  73.81 
 
 		 86 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2207  ribosomal protein S20  75.58 
 
 		 86 aa  114  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.437419  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2223  ribosomal protein S20  73.26 
 
 		 86 aa  114  6e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133967  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  68.6 
 
 		 86 aa  112  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  71.26 
 
 		 92 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  70.93 
 
 		 86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  73.49 
 
 		 88 aa  111  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  68.97 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  73.49 
 
 		 88 aa  110  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  68.6 
 
 		 86 aa  110  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  68.6 
 
 		 86 aa  110  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  68.6 
 
 		 86 aa  110  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  71.43 
 
 		 86 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1261  30S ribosomal protein S20  70.73 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  71.08 
 
 		 90 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  66.28 
 
 		 86 aa  107  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12640  SSU ribosomal protein S20P  74.42 
 
 		 86 aa  107  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.464272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  71.08 
 
 		 86 aa  107  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1556  30S ribosomal protein S20  68.6 
 
 		 86 aa  105  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  68.6 
 
 		 86 aa  105  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  68.29 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  69.88 
 
 		 88 aa  103  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  70.89 
 
 		 95 aa  102  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3262  ribosomal protein S20  68.6 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521997  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0802  ribosomal protein S20  66.28 
 
 		 87 aa  99.4  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.939654  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  68.83 
 
 		 151 aa  99  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  63.95 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  63.95 
 
 		 86 aa  99.4  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  65.12 
 
 		 86 aa  98.2  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  65.12 
 
 		 88 aa  97.8  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2242  30S ribosomal protein S20  67.44 
 
 		 86 aa  97.1  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.636504  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0854  ribosomal protein S20  65.12 
 
 		 86 aa  97.1  8e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1614  ribosomal protein S20  69.77 
 
 		 88 aa  94.7  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3421  ribosomal protein S20  68 
 
 		 86 aa  94  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144385  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12430  SSU ribosomal protein S20P  65.91 
 
 		 88 aa  91.7  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0372924  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1654  ribosomal protein S20  65.12 
 
 		 167 aa  87.8  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.158748  hitchhiker  0.00316633 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0583  30S ribosomal protein S20  63.95 
 
 		 86 aa  85.5  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  54.55 
 
 		 89 aa  83.6  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07740  ribosomal protein S20  62.79 
 
 		 172 aa  83.6  8e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.603346 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  53.49 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  55.81 
 
 		 87 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  55.81 
 
 		 87 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  48.81 
 
 		 89 aa  78.6  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  48.81 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 87 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  49.41 
 
 		 85 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  49.41 
 
 		 85 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  50 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  47.73 
 
 		 88 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  48.24 
 
 		 85 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  48.24 
 
 		 85 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  48.24 
 
 		 85 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  48.24 
 
 		 85 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  48.24 
 
 		 85 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  48.24 
 
 		 85 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  48.24 
 
 		 85 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  48.24 
 
 		 85 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  48.24 
 
 		 85 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  52.33 
 
 		 87 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 85 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  47.73 
 
 		 88 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  46.51 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2575  30S ribosomal protein S20  46.59 
 
 		 90 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1939  30S ribosomal protein S20  46.59 
 
 		 90 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0416  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000443906  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2600  30S ribosomal protein S20  46.59 
 
 		 90 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2551  30S ribosomal protein S20  46.59 
 
 		 90 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2470  30S ribosomal protein S20  46.59 
 
 		 90 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0125567 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3203  30S ribosomal protein S20  43.18 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0745  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 90 aa  67  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.426088 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0919  30S ribosomal protein S20  43.18 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.459642  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0677  30S ribosomal protein S20  43.18 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0377  30S ribosomal protein S20  43.18 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0126  30S ribosomal protein S20  43.18 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1075  30S ribosomal protein S20  43.18 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0923  30S ribosomal protein S20  43.18 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  44.57 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  43.18 
 
 		 88 aa  66.6  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0735  30S ribosomal protein S20  43.18 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2512  30S ribosomal protein S20  43.18 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0225  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477404  normal  0.0381808 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5883  30S ribosomal protein S20  44.32 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2297  30S ribosomal protein S20  53.49 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  49.43 
 
 		 87 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  44.71 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  39.77 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0531  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0759  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1511  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1685  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 87 aa  63.5  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.462249  normal  0.0272644 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 94 aa  63.5  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf244  ribosomal protein S20  49.37 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026073  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0818  30S ribosomal protein S20  51.9 
 
 		 81 aa  63.2  0.000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1902  30S ribosomal protein S20  48.75 
 
 		 77 aa  62.8  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000191113  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1172  30S ribosomal protein S20  51.85 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000575412  hitchhiker  0.00000000402538 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>