More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_17390 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  100 
 
 		 88 aa  169  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  75 
 
 		 86 aa  120  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1261  30S ribosomal protein S20  72.94 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1556  30S ribosomal protein S20  77.11 
 
 		 86 aa  115  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2207  ribosomal protein S20  77.11 
 
 		 86 aa  114  6e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.437419  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  74.07 
 
 		 88 aa  113  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  72.84 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2223  ribosomal protein S20  75.9 
 
 		 86 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133967  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  69.88 
 
 		 86 aa  108  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  68.67 
 
 		 86 aa  105  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  67.86 
 
 		 88 aa  104  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  67.86 
 
 		 88 aa  104  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  69.88 
 
 		 88 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  66.67 
 
 		 86 aa  103  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3262  ribosomal protein S20  69.05 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521997  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  69.14 
 
 		 86 aa  102  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  67.47 
 
 		 86 aa  100  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  67.9 
 
 		 86 aa  100  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  67.09 
 
 		 95 aa  100  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3421  ribosomal protein S20  72 
 
 		 86 aa  99.8  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144385  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  62.35 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  64.2 
 
 		 86 aa  99  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  66.67 
 
 		 86 aa  99  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  65.43 
 
 		 92 aa  95.9  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  63.75 
 
 		 86 aa  95.5  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  64.2 
 
 		 89 aa  95.1  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1654  ribosomal protein S20  65.85 
 
 		 167 aa  94.7  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.158748  hitchhiker  0.00316633 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  63.1 
 
 		 86 aa  94  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  63.41 
 
 		 162 aa  92.8  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2242  30S ribosomal protein S20  68.67 
 
 		 86 aa  92.8  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.636504  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  61.25 
 
 		 86 aa  92  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  61.25 
 
 		 86 aa  92  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  61.25 
 
 		 86 aa  92  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12430  SSU ribosomal protein S20P  75 
 
 		 88 aa  90.1  8e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0372924  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  63.64 
 
 		 151 aa  90.1  8e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0802  ribosomal protein S20  62.65 
 
 		 87 aa  90.1  9e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.939654  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  58.75 
 
 		 86 aa  89.4  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1614  ribosomal protein S20  69.41 
 
 		 88 aa  88.6  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07740  ribosomal protein S20  67.07 
 
 		 172 aa  87  7e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.603346 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12640  SSU ribosomal protein S20P  63.86 
 
 		 86 aa  86.7  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.464272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  56.63 
 
 		 85 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0854  ribosomal protein S20  62.5 
 
 		 86 aa  79.3  0.00000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  56.79 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  54.22 
 
 		 85 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  54.22 
 
 		 85 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  54.22 
 
 		 85 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  54.22 
 
 		 85 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  54.22 
 
 		 85 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  54.22 
 
 		 85 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  54.22 
 
 		 85 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  54.22 
 
 		 85 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  54.22 
 
 		 85 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  54.32 
 
 		 89 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  53.01 
 
 		 85 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  55.56 
 
 		 89 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0583  30S ribosomal protein S20  65 
 
 		 86 aa  73.9  0.0000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  50.6 
 
 		 89 aa  72.4  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  50.63 
 
 		 88 aa  69.3  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  50.6 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  48.19 
 
 		 87 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  46.91 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0416  30S ribosomal protein S20  47.5 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000443906  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  49.4 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1013  30S ribosomal protein S20  45.57 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000773203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0490  ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 99 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0700  ribosomal protein S20  50 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000536683  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  48.1 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0947  ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3655  30S ribosomal protein S20  45.57 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225514  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  45.57 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3849  30S ribosomal protein S20  45.57 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.716428  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  45.57 
 
 		 87 aa  63.5  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  48.75 
 
 		 87 aa  63.5  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  48.75 
 
 		 87 aa  63.5  0.0000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  45.78 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4315  30S ribosomal protein S20  49.38 
 
 		 90 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000159944  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1846  30S ribosomal protein S20  48.75 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  49.38 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  42.53 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2188  30S ribosomal protein S20  48.75 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220995  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0225  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 87 aa  62  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477404  normal  0.0381808 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0696  ribosomal protein S20  45 
 
 		 86 aa  62  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207001  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  48.19 
 
 		 87 aa  62  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0527  ribosomal protein S20  47.5 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 94 aa  62  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  43.75 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000591631  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2689  30S ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2561  30S ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4514  30S ribosomal protein S20  42.5 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0010  30S ribosomal protein S20  49.21 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  38.55 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1341  30S ribosomal protein S20  49.21 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0554  ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 87 aa  60.1  0.000000009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  46.91 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1096  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000700681  normal  0.0325702 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 86 aa  60.1  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0921  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000253205  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>