More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0292 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 87 aa  164  4e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  77.01 
 
 		 87 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  74.42 
 
 		 87 aa  120  5e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0917  30S ribosomal protein S20  67.82 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1685  30S ribosomal protein S20  60.47 
 
 		 87 aa  95.5  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.462249  normal  0.0272644 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0994  30S ribosomal protein S20  54.65 
 
 		 86 aa  90.9  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.945897  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  55.81 
 
 		 87 aa  86.7  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 86 aa  84.3  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  54.65 
 
 		 87 aa  82.8  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  51.16 
 
 		 87 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2044  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 86 aa  75.9  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0771  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 87 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0756  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 87 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000125202  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1416  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.719270000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0741  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 89 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 87 aa  72  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1718  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 88 aa  71.2  0.000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3131  30S ribosomal protein S20  52.33 
 
 		 87 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768382  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1806  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 89 aa  69.3  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0293621  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3551  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 89 aa  69.3  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2297  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 87 aa  67  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0947  ribosomal protein S20  46.91 
 
 		 100 aa  67  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0016  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2436  ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000012228  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  48.19 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0196  ribosomal protein S20  50 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2725  30S ribosomal protein S20  49.37 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0313698  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1598  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1783  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  48.24 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  48.24 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  48.24 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  48.24 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0075  ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  48.24 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  48.24 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3546  30S ribosomal protein S20  41.25 
 
 		 89 aa  62.8  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1965  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  48.24 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 86 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  48.24 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1517  SSU ribosomal protein S20P  41.56 
 
 		 84 aa  62.4  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.256049  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  48.19 
 
 		 88 aa  62  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 86 aa  62  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  48.24 
 
 		 85 aa  62  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  45.78 
 
 		 86 aa  61.6  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2717  30S ribosomal protein S20  50.63 
 
 		 90 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.469442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2817  30S ribosomal protein S20  48.1 
 
 		 91 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2909  30S ribosomal protein S20  48.1 
 
 		 91 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3802  SSU ribosomal protein S20P  45.45 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.042204  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  45.78 
 
 		 86 aa  60.8  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  49.45 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 85 aa  60.5  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1556  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  41.86 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000167926  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4938  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 87 aa  58.9  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  47.67 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  39.76 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1487  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.422821  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1619  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 88 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1667  30S ribosomal protein S20  40.96 
 
 		 88 aa  57  0.00000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00940932  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  45 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3655  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225514  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  47.56 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3849  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.716428  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204572  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000294185  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000408096  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2188  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220995  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3922  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  40.74 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  45 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  45 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000711095  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1846  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1587  30S ribosomal protein S20  34.88 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  45 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000322066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>