278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_10270 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  100 
 
 		 162 aa  294  4e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1654  ribosomal protein S20  65.07 
 
 		 167 aa  151  4e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.158748  hitchhiker  0.00316633 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07740  ribosomal protein S20  66.67 
 
 		 172 aa  139  9.999999999999999e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.603346 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0802  ribosomal protein S20  75.58 
 
 		 87 aa  127  8.000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.939654  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1556  30S ribosomal protein S20  70.93 
 
 		 86 aa  103  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  67.9 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  69.62 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3421  ribosomal protein S20  70.67 
 
 		 86 aa  100  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144385  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  71.6 
 
 		 86 aa  100  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2207  ribosomal protein S20  67.44 
 
 		 86 aa  99  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.437419  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  63.95 
 
 		 86 aa  99.4  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  62.79 
 
 		 86 aa  98.2  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  63.95 
 
 		 88 aa  98.2  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  61.63 
 
 		 89 aa  97.8  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  61.63 
 
 		 86 aa  97.8  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  64.94 
 
 		 151 aa  97.1  9e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  65.82 
 
 		 95 aa  97.1  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  60.47 
 
 		 86 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2242  30S ribosomal protein S20  62.79 
 
 		 86 aa  95.9  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.636504  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12430  SSU ribosomal protein S20P  74.68 
 
 		 88 aa  95.9  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0372924  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2223  ribosomal protein S20  66.28 
 
 		 86 aa  95.5  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133967  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0854  ribosomal protein S20  67.09 
 
 		 86 aa  94  7e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  63.41 
 
 		 88 aa  93.2  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  62.96 
 
 		 86 aa  93.6  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  64.2 
 
 		 107 aa  91.7  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  59.3 
 
 		 86 aa  91.3  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3262  ribosomal protein S20  65.06 
 
 		 90 aa  89.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521997  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  59.49 
 
 		 86 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1261  30S ribosomal protein S20  63.29 
 
 		 89 aa  88.6  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  59.49 
 
 		 86 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  59.49 
 
 		 86 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  60.47 
 
 		 86 aa  88.2  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  62.96 
 
 		 86 aa  86.7  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  58.02 
 
 		 86 aa  85.9  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  59.26 
 
 		 88 aa  85.5  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0583  30S ribosomal protein S20  68.35 
 
 		 86 aa  85.5  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  59.26 
 
 		 88 aa  85.5  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  55.7 
 
 		 86 aa  84.3  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  58.23 
 
 		 86 aa  84.3  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1614  ribosomal protein S20  66.67 
 
 		 88 aa  82.4  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  58.54 
 
 		 88 aa  80.9  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12640  SSU ribosomal protein S20P  55.81 
 
 		 86 aa  77.8  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.464272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  53.57 
 
 		 89 aa  74.7  0.0000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  48.28 
 
 		 95 aa  73.6  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  55.84 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  55.84 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  48.05 
 
 		 88 aa  68.2  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  44.05 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  49.35 
 
 		 88 aa  63.5  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000591631  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0818  30S ribosomal protein S20  48.78 
 
 		 81 aa  63.5  0.000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1919  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 99 aa  62.4  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000179184  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0700  ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 92 aa  62  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000536683  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0527  ribosomal protein S20  49.35 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  48.05 
 
 		 94 aa  60.8  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1416  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 87 aa  60.5  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.719270000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  48.24 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  43.96 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3181  30S ribosomal protein S20  46.75 
 
 		 87 aa  58.9  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0928109  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  46.75 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  48.1 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  48.1 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000711095  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  48.1 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000322066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3537  30S ribosomal protein S20  48.1 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl368.1  30S ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.5112799999999996e-45  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2024  ribosomal protein S20  42.5 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000205272  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  47.5 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  45.56 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2297  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1134  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000567629  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  46.75 
 
 		 90 aa  57.4  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_002936  DET1639  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000663879  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 85 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 85 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 85 aa  57  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 85 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1521  ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000787873  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 88 aa  57  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 85 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 85 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2835  ribosomal protein S20  37.66 
 
 		 90 aa  57  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.621113 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0416  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000443906  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  44.16 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1587  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 85 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 85 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  40.7 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000294185  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4315  30S ribosomal protein S20  43.21 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000159944  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0947  ribosomal protein S20  41.98 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>