More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1932 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  100 
 
 
88 aa  168  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000591631  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0527  ribosomal protein S20  80.23 
 
 
88 aa  137  4.999999999999999e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  51.16 
 
 
95 aa  84.7  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  52.33 
 
 
94 aa  82  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0700  ribosomal protein S20  51.16 
 
 
92 aa  79  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000536683  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1520  30S ribosomal protein S20  52.87 
 
 
98 aa  78.6  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  50.57 
 
 
87 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  50.57 
 
 
87 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4205  30S ribosomal protein S20  48.39 
 
 
97 aa  77  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.885045 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1019  30S ribosomal protein S20  50 
 
 
116 aa  76.3  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  53.66 
 
 
94 aa  76.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3551  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 
89 aa  74.3  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2024  ribosomal protein S20  46.59 
 
 
90 aa  73.6  0.0000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000205272  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 
86 aa  72.8  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 
89 aa  73.6  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4514  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 
89 aa  72.4  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  45.45 
 
 
88 aa  72  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2069  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 
98 aa  71.6  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 
91 aa  70.9  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 
92 aa  70.9  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  45.35 
 
 
86 aa  70.5  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1106  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 
93 aa  70.1  0.000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00644283  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3104  ribosomal protein S20  46.59 
 
 
90 aa  69.7  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0859  30S ribosomal protein S20  44.32 
 
 
89 aa  69.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000132311  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  45.35 
 
 
86 aa  68.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3802  SSU ribosomal protein S20P  43.96 
 
 
88 aa  68.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.042204  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0739  30S ribosomal protein S20  50.57 
 
 
97 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  43.02 
 
 
92 aa  68.6  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1013  30S ribosomal protein S20  40.91 
 
 
88 aa  68.2  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000773203  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1846  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 
91 aa  67.8  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 
87 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  42.05 
 
 
89 aa  68.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4233  ribosomal protein S20  43.68 
 
 
87 aa  68.2  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000543427  hitchhiker  0.000000915309 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1780  30S ribosomal protein S20  41.05 
 
 
97 aa  67.8  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1753  30S ribosomal protein S20  41.05 
 
 
97 aa  67.8  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
89 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2188  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 
91 aa  67.8  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220995  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2941  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 
112 aa  68.2  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.205918  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04341  30S ribosomal protein S20  41.11 
 
 
100 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0490  ribosomal protein S20  45.05 
 
 
99 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 
86 aa  67.8  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  49.43 
 
 
87 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 
88 aa  67.4  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1587  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 
88 aa  67.4  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0802  ribosomal protein S20  43.02 
 
 
87 aa  66.2  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.939654  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  44.32 
 
 
88 aa  66.2  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 
85 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1018  30S ribosomal protein S20  43.18 
 
 
98 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.859687  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 
86 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  40.91 
 
 
88 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  40.91 
 
 
88 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204572  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1261  30S ribosomal protein S20  46.25 
 
 
89 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18881  30S ribosomal protein S20  43.18 
 
 
98 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.825907  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 
86 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3079  SSU ribosomal protein S20P  48.86 
 
 
88 aa  65.9  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0239933  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  36.36 
 
 
91 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  40.91 
 
 
88 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2242  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 
86 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.636504  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  40.91 
 
 
88 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000294185  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  40.91 
 
 
88 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000408096  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 
86 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  42.86 
 
 
88 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  44.71 
 
 
85 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  44.71 
 
 
85 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  40.91 
 
 
88 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  40.91 
 
 
88 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000711095  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  40.91 
 
 
88 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000322066  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  43.75 
 
 
107 aa  64.3  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3274  ribosomal protein S20  43.02 
 
 
86 aa  64.3  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 
92 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  39.77 
 
 
88 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000303326  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  43.18 
 
 
90 aa  63.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 
85 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  45.35 
 
 
162 aa  62.8  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 
85 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 
85 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 
85 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 
85 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 
85 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 
90 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0603  30S ribosomal protein S20  41.11 
 
 
98 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 
85 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 
85 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16091  30S ribosomal protein S20  41.94 
 
 
100 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3421  ribosomal protein S20  43.84 
 
 
86 aa  63.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144385  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  40.7 
 
 
86 aa  62.4  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3537  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 
88 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1341  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 
92 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2893  30S ribosomal protein S20  37.5 
 
 
88 aa  62.8  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204979  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0010  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 
92 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0921  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 
88 aa  62.8  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000253205  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1383  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 
88 aa  62  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000140868  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  41.86 
 
 
88 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1096  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 
88 aa  61.6  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000700681  normal  0.0325702 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1755  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 
91 aa  61.6  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00299182  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  43.75 
 
 
88 aa  61.6  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  42.86 
 
 
151 aa  62  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0947  ribosomal protein S20  40.51 
 
 
100 aa  61.2  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  41.25 
 
 
86 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>