More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2206 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 87 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  78.16 
 
 		 87 aa  132  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  72.41 
 
 		 87 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0771  30S ribosomal protein S20  74.71 
 
 		 87 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0756  30S ribosomal protein S20  74.71 
 
 		 87 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000125202  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2297  30S ribosomal protein S20  81.61 
 
 		 87 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3131  30S ribosomal protein S20  78.16 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768382  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1416  30S ribosomal protein S20  57.47 
 
 		 87 aa  96.7  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.719270000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  51.16 
 
 		 87 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  50.57 
 
 		 87 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 87 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  51.72 
 
 		 87 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 88 aa  73.9  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1685  30S ribosomal protein S20  49.43 
 
 		 87 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.462249  normal  0.0272644 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  50 
 
 		 88 aa  73.6  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 86 aa  72.8  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0917  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 89 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 90 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 91 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 92 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  45.98 
 
 		 92 aa  71.2  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  44.83 
 
 		 88 aa  71.2  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3551  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 89 aa  70.1  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0600  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0646  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0802  ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0707  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4562  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0641  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647122  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  50 
 
 		 86 aa  69.7  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 86 aa  69.7  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2207  ribosomal protein S20  51.16 
 
 		 86 aa  69.7  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.437419  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 86 aa  68.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3922  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 89 aa  69.3  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2188  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 91 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220995  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1846  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 91 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2223  ribosomal protein S20  51.16 
 
 		 86 aa  68.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133967  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 86 aa  68.2  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1013  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 88 aa  68.2  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000773203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 88 aa  68.2  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000591631  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 89 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2436  ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 88 aa  68.2  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000012228  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0741  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 89 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 86 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0001  ribosomal protein S20  48.28 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0152754  hitchhiker  4.7444199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 86 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 86 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1851  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 85 aa  67  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153363  hitchhiker  0.000963738 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0527  ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 88 aa  67  0.00000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 88 aa  67  0.00000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0819  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 84 aa  67  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4641  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647122  hitchhiker  0.00990259 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4370  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664055 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1487  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.422821  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 89 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1667  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00940932  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  47.95 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2689  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2561  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 86 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  43.02 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 84 aa  65.5  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000167926  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 86 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 86 aa  64.3  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0802  ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.939654  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  46.51 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 86 aa  63.9  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 95 aa  63.5  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3104  ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 90 aa  63.5  0.0000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  46.91 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1806  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 89 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0293621  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  47.95 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3262  ribosomal protein S20  49.38 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521997  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  45.78 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  47.95 
 
 		 95 aa  63.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  62  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1576  ribosomal protein S20  45 
 
 		 89 aa  62  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0075  ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 91 aa  62  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6963  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4514  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 89 aa  62  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3802  SSU ribosomal protein S20P  37.93 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.042204  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5203  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 91 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.614694  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1261  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3421  ribosomal protein S20  49.32 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144385  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2044  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 86 aa  60.8  0.000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0947  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000396831  normal  0.19884 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1556  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>