284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0700 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_0700  ribosomal protein S20  100 
 
 		 92 aa  180  5.0000000000000004e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000536683  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0527  ribosomal protein S20  53.49 
 
 		 88 aa  80.9  0.000000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  50.55 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  51.16 
 
 		 88 aa  79  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000591631  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  51.16 
 
 		 88 aa  77.4  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  49.35 
 
 		 87 aa  73.2  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  44.33 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1755  30S ribosomal protein S20  48.24 
 
 		 91 aa  72.4  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00299182  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0126  30S ribosomal protein S20  47.83 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000563837  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 86 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1846  30S ribosomal protein S20  45.05 
 
 		 91 aa  68.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1134  30S ribosomal protein S20  43.3 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000567629  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2188  30S ribosomal protein S20  45.05 
 
 		 91 aa  68.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220995  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  42.22 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2242  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 86 aa  67  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.636504  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1587  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 88 aa  67  0.00000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 86 aa  64.7  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0802  ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.939654  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  50 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3462  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000449993  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1580  30S ribosomal protein S20  40.21 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0792  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000429038  normal  0.540603 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3590  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000579115  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1106  30S ribosomal protein S20  44.16 
 
 		 93 aa  62.8  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00644283  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  45.35 
 
 		 92 aa  62  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4205  30S ribosomal protein S20  39.18 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.885045 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16091  30S ribosomal protein S20  43.3 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0490  ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 99 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2024  ribosomal protein S20  41.11 
 
 		 90 aa  62  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000205272  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  46.25 
 
 		 86 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3274  ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 86 aa  62  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1780  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1753  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3537  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1019  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  48.78 
 
 		 94 aa  60.8  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1096  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000700681  normal  0.0325702 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  45 
 
 		 86 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3655  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225514  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3849  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.716428  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4514  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16911  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04341  30S ribosomal protein S20  40.21 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  44.71 
 
 		 85 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1919  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000179184  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00027  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000413778  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3575  ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021535  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3631  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000506786  normal  0.726814 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0027  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000024189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0094  ribosomal protein S20  40.45 
 
 		 89 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0026  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000013085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  44.19 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1520  30S ribosomal protein S20  40.66 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16781  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0022  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000378838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0947  ribosomal protein S20  46.75 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0025  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.87642e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0023  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000255802  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00026  hypothetical protein  37.21 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000313857  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000711095  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000322066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  46.25 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0741  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  38.89 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4315  30S ribosomal protein S20  44.16 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000159944  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3262  ribosomal protein S20  43.18 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521997  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  45.57 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1261  30S ribosomal protein S20  44.71 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12430  SSU ribosomal protein S20P  47.13 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0372924  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3181  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0928109  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16671  30S ribosomal protein S20  40.62 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>