More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1552 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  100 
 
 		 86 aa  164  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  75.9 
 
 		 90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  69.77 
 
 		 86 aa  113  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  73.49 
 
 		 88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  73.49 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  74.68 
 
 		 95 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  71.43 
 
 		 88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  70.93 
 
 		 86 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  68.6 
 
 		 86 aa  107  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  68.67 
 
 		 88 aa  105  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  67.44 
 
 		 92 aa  105  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2207  ribosomal protein S20  70.93 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.437419  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  70.24 
 
 		 86 aa  105  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1556  30S ribosomal protein S20  72.62 
 
 		 86 aa  105  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  72.15 
 
 		 107 aa  105  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  67.86 
 
 		 86 aa  103  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2223  ribosomal protein S20  73.81 
 
 		 86 aa  103  8e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133967  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  72.15 
 
 		 89 aa  103  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  68.35 
 
 		 88 aa  103  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  68.6 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  67.44 
 
 		 86 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1261  30S ribosomal protein S20  70.89 
 
 		 89 aa  102  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  67.44 
 
 		 86 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  67.44 
 
 		 86 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  70.89 
 
 		 86 aa  100  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  67.44 
 
 		 86 aa  100  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  61.63 
 
 		 86 aa  100  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  70.13 
 
 		 151 aa  100  9e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3262  ribosomal protein S20  69.14 
 
 		 90 aa  99.4  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521997  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  62.79 
 
 		 162 aa  98.6  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  64.29 
 
 		 86 aa  96.3  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0802  ribosomal protein S20  61.9 
 
 		 87 aa  91.3  4e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.939654  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2242  30S ribosomal protein S20  66.67 
 
 		 86 aa  90.1  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.636504  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07740  ribosomal protein S20  63.95 
 
 		 172 aa  90.1  9e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.603346 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12640  SSU ribosomal protein S20P  66.67 
 
 		 86 aa  88.6  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.464272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  60.76 
 
 		 86 aa  87  7e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1654  ribosomal protein S20  60.47 
 
 		 167 aa  86.3  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.158748  hitchhiker  0.00316633 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3421  ribosomal protein S20  65.33 
 
 		 86 aa  86.7  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144385  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1614  ribosomal protein S20  68.35 
 
 		 88 aa  83.6  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0854  ribosomal protein S20  60.71 
 
 		 86 aa  82  0.000000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  49.41 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12430  SSU ribosomal protein S20P  65.82 
 
 		 88 aa  79.3  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0372924  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  54.12 
 
 		 89 aa  77  0.00000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 87 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0583  30S ribosomal protein S20  64.29 
 
 		 86 aa  72.8  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 88 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  48.84 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 87 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 87 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 87 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  48.81 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0947  ribosomal protein S20  49.38 
 
 		 100 aa  67.4  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  48.81 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  48.81 
 
 		 85 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 89 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1265  ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.15154e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2297  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 88 aa  63.5  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00027  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000413778  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3575  ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021535  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00026  hypothetical protein  44.19 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000313857  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 94 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1416  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.719270000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0026  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000013085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0027  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000024189  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3631  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000506786  normal  0.726814 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0022  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000378838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0025  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.87642e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0023  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000255802  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  44.44 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  50.63 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2817  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2909  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 85 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 85 aa  60.5  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0048  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000161385  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0047  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000542728  normal  0.0144218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0048  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000398649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0047  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00000872417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0047  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000090572  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1685  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.462249  normal  0.0272644 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0554  ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1134  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 96 aa  60.1  0.000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000567629  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2561  30S ribosomal protein S20  46.25 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>