More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3421 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3421  ribosomal protein S20  100 
 
 		 86 aa  160  7e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144385  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  74.42 
 
 		 107 aa  120  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  72.09 
 
 		 86 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  73.26 
 
 		 86 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  77.78 
 
 		 86 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1261  30S ribosomal protein S20  70.93 
 
 		 89 aa  113  8.999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  69.77 
 
 		 86 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  69.77 
 
 		 86 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  69.77 
 
 		 86 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  75.61 
 
 		 86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  73.81 
 
 		 86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  72.84 
 
 		 86 aa  111  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  72.09 
 
 		 86 aa  111  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2207  ribosomal protein S20  80.25 
 
 		 86 aa  110  8.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.437419  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  70.93 
 
 		 86 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  72.84 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  74.07 
 
 		 92 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2223  ribosomal protein S20  76.83 
 
 		 86 aa  108  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133967  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1556  30S ribosomal protein S20  78.05 
 
 		 86 aa  107  6e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3262  ribosomal protein S20  76.19 
 
 		 90 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521997  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  70.24 
 
 		 88 aa  106  9.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  68.67 
 
 		 162 aa  105  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  63.95 
 
 		 86 aa  104  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2242  30S ribosomal protein S20  72.84 
 
 		 86 aa  103  9e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.636504  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  70.37 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  68.29 
 
 		 88 aa  101  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  65.12 
 
 		 86 aa  99.8  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  67.9 
 
 		 88 aa  99.4  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  69.62 
 
 		 95 aa  98.6  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  67.9 
 
 		 88 aa  99.4  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1654  ribosomal protein S20  67.09 
 
 		 167 aa  98.6  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.158748  hitchhiker  0.00316633 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0802  ribosomal protein S20  65.43 
 
 		 87 aa  98.2  3e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.939654  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  67.9 
 
 		 90 aa  97.1  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  67.53 
 
 		 151 aa  96.7  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  69.05 
 
 		 86 aa  95.9  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12430  SSU ribosomal protein S20P  77.5 
 
 		 88 aa  94.4  4e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0372924  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0854  ribosomal protein S20  71.25 
 
 		 86 aa  92  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  64.2 
 
 		 86 aa  91.7  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07740  ribosomal protein S20  67.44 
 
 		 172 aa  90.1  9e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.603346 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1614  ribosomal protein S20  72.84 
 
 		 88 aa  86.7  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  58.02 
 
 		 95 aa  86.3  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0583  30S ribosomal protein S20  69.51 
 
 		 86 aa  85.5  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12640  SSU ribosomal protein S20P  63.95 
 
 		 86 aa  84.7  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.464272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  53.09 
 
 		 89 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  53.09 
 
 		 89 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  51.95 
 
 		 94 aa  72.8  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  51.25 
 
 		 88 aa  72.8  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1846  30S ribosomal protein S20  47.5 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2188  30S ribosomal protein S20  47.5 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220995  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  51.22 
 
 		 89 aa  69.3  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  49.38 
 
 		 88 aa  68.2  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0527  ribosomal protein S20  47.5 
 
 		 88 aa  68.2  0.00000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0947  ribosomal protein S20  48.15 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  43.75 
 
 		 88 aa  67.4  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000591631  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  48.75 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  48.75 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  49.38 
 
 		 88 aa  67.4  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4315  30S ribosomal protein S20  49.41 
 
 		 90 aa  67.4  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000159944  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  46.91 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  45.57 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0696  ribosomal protein S20  48.05 
 
 		 86 aa  65.5  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207001  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1184  ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0416  30S ribosomal protein S20  47.5 
 
 		 87 aa  65.1  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000443906  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  48.15 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1013  30S ribosomal protein S20  48.05 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000773203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  48.15 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0490  ribosomal protein S20  42.7 
 
 		 99 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  45.57 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  48.05 
 
 		 90 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0641  30S ribosomal protein S20  47.37 
 
 		 92 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647122  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0600  30S ribosomal protein S20  47.37 
 
 		 92 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218047  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  46.91 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0802  ribosomal protein S20  47.37 
 
 		 92 aa  62  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  46.91 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  46.91 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  46.91 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0707  30S ribosomal protein S20  47.37 
 
 		 92 aa  62  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1018  30S ribosomal protein S20  46.81 
 
 		 98 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.859687  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18881  30S ribosomal protein S20  46.81 
 
 		 98 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.825907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0603  30S ribosomal protein S20  45.16 
 
 		 98 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  46.91 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  46.91 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0646  30S ribosomal protein S20  47.37 
 
 		 92 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  46.91 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  46.75 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4562  30S ribosomal protein S20  47.37 
 
 		 92 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  46.91 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  48.78 
 
 		 87 aa  62  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  46.75 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0554  ribosomal protein S20  45.57 
 
 		 87 aa  62  0.000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0700  ribosomal protein S20  45 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000536683  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2069  30S ribosomal protein S20  47.31 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  46.91 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0818  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 81 aa  61.2  0.000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  48.19 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1587  30S ribosomal protein S20  40.74 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  45.12 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>