More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0827 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  100 
 
 		 92 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  85.06 
 
 		 89 aa  145  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  83.72 
 
 		 90 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  89.87 
 
 		 95 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  80.72 
 
 		 88 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  80.72 
 
 		 88 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  76.74 
 
 		 86 aa  124  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  80.52 
 
 		 151 aa  121  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  72.09 
 
 		 88 aa  116  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  72.09 
 
 		 86 aa  113  8.999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  71.26 
 
 		 88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3262  ribosomal protein S20  77.78 
 
 		 90 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521997  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  67.44 
 
 		 86 aa  108  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  68.6 
 
 		 86 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  65.12 
 
 		 86 aa  106  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  65.12 
 
 		 86 aa  106  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  65.12 
 
 		 86 aa  106  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  69.77 
 
 		 86 aa  106  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  67.44 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12640  SSU ribosomal protein S20P  72.09 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.464272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  66.28 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2207  ribosomal protein S20  70.93 
 
 		 86 aa  104  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.437419  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  61.63 
 
 		 86 aa  103  7e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  67.9 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1261  30S ribosomal protein S20  69.14 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  69.14 
 
 		 107 aa  101  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  63.95 
 
 		 86 aa  100  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  65.12 
 
 		 86 aa  100  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3421  ribosomal protein S20  72 
 
 		 86 aa  99.8  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144385  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2223  ribosomal protein S20  68.6 
 
 		 86 aa  99.8  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133967  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2242  30S ribosomal protein S20  66.28 
 
 		 86 aa  99  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.636504  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1556  30S ribosomal protein S20  65.12 
 
 		 86 aa  97.4  6e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  64.63 
 
 		 86 aa  96.3  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  65.43 
 
 		 88 aa  95.9  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0802  ribosomal protein S20  60.92 
 
 		 87 aa  95.5  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.939654  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  59.3 
 
 		 86 aa  95.1  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1654  ribosomal protein S20  68.35 
 
 		 167 aa  93.6  8e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.158748  hitchhiker  0.00316633 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1614  ribosomal protein S20  66.28 
 
 		 88 aa  92.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12430  SSU ribosomal protein S20P  68.6 
 
 		 88 aa  89.7  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0372924  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  58.14 
 
 		 87 aa  89.4  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  58.14 
 
 		 87 aa  89.4  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07740  ribosomal protein S20  69.14 
 
 		 172 aa  89.4  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.603346 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0854  ribosomal protein S20  61.63 
 
 		 86 aa  85.9  2e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  55.81 
 
 		 95 aa  84  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0583  30S ribosomal protein S20  62.79 
 
 		 86 aa  82  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  51.9 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  50 
 
 		 88 aa  74.3  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  48.91 
 
 		 89 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  53.09 
 
 		 89 aa  73.2  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  46.67 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  47.19 
 
 		 89 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  52.44 
 
 		 94 aa  69.3  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  68.2  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000591631  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1134  30S ribosomal protein S20  45.56 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000567629  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  43.48 
 
 		 94 aa  67  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1576  ribosomal protein S20  48.19 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  46.75 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1587  30S ribosomal protein S20  43.33 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0527  ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 84 aa  62.8  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000167926  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1184  ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0700  ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 92 aa  62  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000536683  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 85 aa  62  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 87 aa  62  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  50.65 
 
 		 90 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf244  ribosomal protein S20  46.75 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026073  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1511  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 85 aa  60.5  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4315  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000159944  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0947  ribosomal protein S20  48.15 
 
 		 100 aa  60.1  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2024  ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 90 aa  60.1  0.000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000205272  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2188  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 91 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220995  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1013  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000773203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1846  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 91 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1172  30S ribosomal protein S20  46.34 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000575412  hitchhiker  0.00000000402538 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0818  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3551  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0850  30S ribosomal protein S20  48.19 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000116553  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 92 aa  57  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0950  30S ribosomal protein S20  46.99 
 
 		 77 aa  57  0.00000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0608659  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2575  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2069  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1939  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2470  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0125567 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2600  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2835  ribosomal protein S20  38.55 
 
 		 90 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.621113 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2551  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0531  30S ribosomal protein S20  39.56 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1780  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1383  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000140868  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4233  ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000543427  hitchhiker  0.000000915309 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1520  30S ribosomal protein S20  41.84 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3210  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>