More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2318 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 87 aa  157  5e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  60.92 
 
 		 87 aa  87.4  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  60.92 
 
 		 87 aa  87.4  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  56.32 
 
 		 88 aa  87.4  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  51.72 
 
 		 88 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  50.57 
 
 		 88 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  51.16 
 
 		 95 aa  82  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  51.72 
 
 		 87 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 88 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 94 aa  74.3  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  51.72 
 
 		 87 aa  73.9  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 87 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3922  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 88 aa  73.2  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  49.43 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 87 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 86 aa  71.2  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  47.62 
 
 		 105 aa  70.9  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0001  ribosomal protein S20  48.28 
 
 		 87 aa  71.2  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0152754  hitchhiker  4.7444199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3551  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 89 aa  69.7  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 86 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1184  ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  51.85 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0756  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000125202  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1416  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.719270000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0771  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 86 aa  68.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0917  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 89 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  50 
 
 		 86 aa  67.4  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1556  30S ribosomal protein S20  53.49 
 
 		 86 aa  67.8  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0490  ribosomal protein S20  51.65 
 
 		 99 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  49.43 
 
 		 88 aa  67.4  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000591631  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 86 aa  67.4  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1718  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 88 aa  67  0.00000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1919  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 99 aa  66.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000179184  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 86 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0947  ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 100 aa  66.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3188  30S ribosomal protein S20  50.57 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0921444 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3079  SSU ribosomal protein S20P  43.68 
 
 		 88 aa  66.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0239933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 86 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 86 aa  66.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1576  ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 89 aa  65.5  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2242  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 86 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.636504  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  41.38 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0001  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.714217 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  48.19 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  48.24 
 
 		 85 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  48.84 
 
 		 86 aa  65.1  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0002  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000000182845  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  45.57 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 86 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4890  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.540354  normal  0.302297 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 86 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4514  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 89 aa  65.1  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 86 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3131  30S ribosomal protein S20  49.43 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768382  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2223  ribosomal protein S20  50 
 
 		 86 aa  64.7  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133967  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  48.24 
 
 		 85 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2098  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00199179  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2185  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  48.24 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0001  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 86 aa  63.5  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 115 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000562255  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0075  ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4102  SSU ribosomal protein S20P  47.67 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 88 aa  62  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2207  ribosomal protein S20  50 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.437419  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1587  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0792  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000429038  normal  0.540603 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1520  30S ribosomal protein S20  46.15 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1281  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000755686  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3590  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000579115  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  62  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3462  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000449993  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 86 aa  62  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0001  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1685  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.462249  normal  0.0272644 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6963  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3802  SSU ribosomal protein S20P  39.08 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.042204  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0001  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00020529  normal  0.124488 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  36.78 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>