More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1979 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  100 
 
 		 85 aa  159  9e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  67.06 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000562255  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4315  30S ribosomal protein S20  55 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000159944  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  58.14 
 
 		 87 aa  79  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  58.14 
 
 		 87 aa  79  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  53.57 
 
 		 88 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  52.38 
 
 		 88 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  52.33 
 
 		 89 aa  73.6  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  52.33 
 
 		 89 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 85 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 85 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 85 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 85 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 85 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 86 aa  72  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 85 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  48.81 
 
 		 105 aa  72  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 85 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 85 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 85 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1919  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 99 aa  70.9  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000179184  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 85 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  48.24 
 
 		 88 aa  70.5  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 85 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1576  ribosomal protein S20  48.78 
 
 		 89 aa  70.5  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  51.16 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 86 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  50 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 86 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 86 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 86 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0490  ribosomal protein S20  45.05 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 86 aa  65.5  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  46.75 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  48.24 
 
 		 87 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0850  30S ribosomal protein S20  48.15 
 
 		 78 aa  65.1  0.0000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000116553  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2207  ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 86 aa  64.7  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.437419  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1556  30S ribosomal protein S20  48.24 
 
 		 86 aa  64.3  0.0000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1520  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 98 aa  63.5  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  49.38 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  47.06 
 
 		 92 aa  62  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1755  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00299182  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2223  ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133967  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  49.37 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 94 aa  62.4  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1153  30S ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 83 aa  62  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.320164  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3262  ribosomal protein S20  49.38 
 
 		 90 aa  62  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521997  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 87 aa  62  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1184  ribosomal protein S20  50 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  48.15 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  47.5 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  47.56 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1753  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1780  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  43.68 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  48.72 
 
 		 95 aa  60.1  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1383  30S ribosomal protein S20  48.28 
 
 		 88 aa  60.1  0.000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000140868  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1639  30S ribosomal protein S20  49.43 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000663879  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  48.15 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  48.15 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1851  30S ribosomal protein S20  41.46 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153363  hitchhiker  0.000963738 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1521  ribosomal protein S20  49.43 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000787873  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2835  ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 90 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.621113 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1583  30S ribosomal protein S20  42.5 
 
 		 83 aa  60.1  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.74402  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  46.15 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0854  ribosomal protein S20  49.41 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  41.46 
 
 		 89 aa  59.3  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0647  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000292559  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1134  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000567629  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1902  30S ribosomal protein S20  43.9 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000191113  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  48.19 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1261  30S ribosomal protein S20  43.21 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12640  SSU ribosomal protein S20P  45.24 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.464272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0950  30S ribosomal protein S20  41.98 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0608659  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  46.91 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0739  30S ribosomal protein S20  45.56 
 
 		 97 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3849  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.716428  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1678  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1643  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.137149  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0554  ribosomal protein S20  39.29 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3655  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225514  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1614  ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2436  ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000012228  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0001  ribosomal protein S20  40 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0152754  hitchhiker  4.7444199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1106  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00644283  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0290  ribosomal protein S20  50.82 
 
 		 73 aa  55.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000431613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>