More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1005 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 89 aa  167  6e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  91.01 
 
 		 89 aa  153  8e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  76.47 
 
 		 85 aa  121  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  75.29 
 
 		 85 aa  120  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  74.12 
 
 		 85 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  74.12 
 
 		 85 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  74.12 
 
 		 85 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  74.12 
 
 		 85 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  74.12 
 
 		 85 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  74.12 
 
 		 85 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  74.12 
 
 		 85 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  74.12 
 
 		 85 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  72.94 
 
 		 85 aa  118  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  57.47 
 
 		 87 aa  87.8  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  56.18 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0696  ribosomal protein S20  54.65 
 
 		 86 aa  84.7  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207001  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  55.81 
 
 		 86 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  54.65 
 
 		 88 aa  84.3  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  56.32 
 
 		 87 aa  84  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  49.44 
 
 		 90 aa  84  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  54.55 
 
 		 88 aa  83.6  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0600  30S ribosomal protein S20  53.16 
 
 		 92 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4562  30S ribosomal protein S20  53.16 
 
 		 92 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0641  30S ribosomal protein S20  53.16 
 
 		 92 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647122  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0802  ribosomal protein S20  53.16 
 
 		 92 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0646  30S ribosomal protein S20  53.16 
 
 		 92 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0707  30S ribosomal protein S20  53.16 
 
 		 92 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  52.33 
 
 		 88 aa  82.8  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  51.16 
 
 		 91 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3849  30S ribosomal protein S20  55.17 
 
 		 87 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.716428  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  54.55 
 
 		 88 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  54.55 
 
 		 88 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  54.55 
 
 		 88 aa  82  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  54.55 
 
 		 88 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000408096  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  54.55 
 
 		 88 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000294185  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  54.55 
 
 		 88 aa  82.4  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3655  30S ribosomal protein S20  55.17 
 
 		 87 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225514  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  54.55 
 
 		 88 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204572  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  53.49 
 
 		 87 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  53.49 
 
 		 87 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  55.81 
 
 		 86 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  51.16 
 
 		 86 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  51.16 
 
 		 86 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  54.65 
 
 		 86 aa  81.6  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  51.16 
 
 		 86 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1261  30S ribosomal protein S20  51.69 
 
 		 89 aa  81.6  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  48.86 
 
 		 88 aa  81.3  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2893  30S ribosomal protein S20  54.55 
 
 		 88 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204979  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  53.16 
 
 		 91 aa  80.1  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2689  30S ribosomal protein S20  54.55 
 
 		 88 aa  79.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2561  30S ribosomal protein S20  54.55 
 
 		 88 aa  79.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1013  30S ribosomal protein S20  48.86 
 
 		 88 aa  79.7  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000773203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0921  30S ribosomal protein S20  51.14 
 
 		 88 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000253205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  51.16 
 
 		 95 aa  80.1  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4233  ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 87 aa  79.3  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000543427  hitchhiker  0.000000915309 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  58.23 
 
 		 86 aa  78.6  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  53.41 
 
 		 88 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0950  30S ribosomal protein S20  57.83 
 
 		 77 aa  78.2  0.00000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0608659  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0416  30S ribosomal protein S20  56.63 
 
 		 87 aa  77.8  0.00000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000443906  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0850  30S ribosomal protein S20  59.04 
 
 		 78 aa  78.2  0.00000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000116553  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3462  30S ribosomal protein S20  51.72 
 
 		 87 aa  77.4  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000449993  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 86 aa  77.4  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0792  30S ribosomal protein S20  51.72 
 
 		 87 aa  77.4  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000429038  normal  0.540603 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3590  30S ribosomal protein S20  51.72 
 
 		 87 aa  77.4  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000579115  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  52.27 
 
 		 88 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  52.27 
 
 		 88 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000711095  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  52.27 
 
 		 88 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000322066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  55.56 
 
 		 88 aa  77.4  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  48.31 
 
 		 89 aa  77.4  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  53.16 
 
 		 92 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3537  30S ribosomal protein S20  52.27 
 
 		 88 aa  77  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3262  ribosomal protein S20  56.1 
 
 		 90 aa  77  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521997  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  51.16 
 
 		 86 aa  76.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12640  SSU ribosomal protein S20P  54.44 
 
 		 86 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.464272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  50 
 
 		 87 aa  76.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  52.33 
 
 		 86 aa  76.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  53.16 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 88 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  48.84 
 
 		 86 aa  75.9  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  50 
 
 		 88 aa  75.5  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1096  30S ribosomal protein S20  51.14 
 
 		 88 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000700681  normal  0.0325702 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00027  30S ribosomal protein S20  52.33 
 
 		 87 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000413778  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3575  ribosomal protein S20  52.33 
 
 		 87 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021535  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0023  30S ribosomal protein S20  52.33 
 
 		 87 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000255802  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0027  30S ribosomal protein S20  52.33 
 
 		 87 aa  74.3  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000024189  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00026  hypothetical protein  52.33 
 
 		 87 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000313857  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0022  30S ribosomal protein S20  52.33 
 
 		 87 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000378838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1902  30S ribosomal protein S20  57.14 
 
 		 77 aa  74.3  0.0000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000191113  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0025  30S ribosomal protein S20  52.33 
 
 		 87 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.87642e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0026  30S ribosomal protein S20  52.33 
 
 		 87 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000013085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3631  30S ribosomal protein S20  52.33 
 
 		 87 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000506786  normal  0.726814 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 86 aa  73.9  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  53.66 
 
 		 86 aa  73.9  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4315  30S ribosomal protein S20  51.22 
 
 		 90 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000159944  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0492  ribosomal protein S20  53.16 
 
 		 87 aa  73.6  0.0000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.131868  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  48.91 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 88 aa  73.2  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0554  ribosomal protein S20  48.28 
 
 		 87 aa  73.2  0.000000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0047  30S ribosomal protein S20  52.33 
 
 		 87 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000090572  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  52.33 
 
 		 85 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>