More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2299 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 87 aa  161  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 87 aa  161  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  58.14 
 
 		 95 aa  94.7  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  57.47 
 
 		 88 aa  92.4  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  58.14 
 
 		 92 aa  89.4  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  52.33 
 
 		 86 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  52.33 
 
 		 86 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  52.33 
 
 		 86 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  60.92 
 
 		 87 aa  87.4  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  53.57 
 
 		 86 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  55 
 
 		 86 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  55.81 
 
 		 86 aa  84  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  52.87 
 
 		 88 aa  84  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  51.72 
 
 		 87 aa  82.8  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  53.49 
 
 		 86 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  52.38 
 
 		 88 aa  82  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  53.49 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  52.33 
 
 		 86 aa  82.8  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  55.81 
 
 		 88 aa  81.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  50 
 
 		 89 aa  81.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  54.65 
 
 		 86 aa  81.3  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  51.16 
 
 		 89 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  54.55 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  52.38 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  56.1 
 
 		 86 aa  80.1  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  58.14 
 
 		 85 aa  79  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  50.57 
 
 		 88 aa  78.2  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000591631  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  54.22 
 
 		 88 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  53.01 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  53.01 
 
 		 88 aa  77.4  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12640  SSU ribosomal protein S20P  56.98 
 
 		 86 aa  77.4  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.464272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  55.84 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  50.57 
 
 		 88 aa  77  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  52.33 
 
 		 94 aa  76.3  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  48.28 
 
 		 88 aa  76.3  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  50 
 
 		 86 aa  75.9  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2242  30S ribosomal protein S20  54.65 
 
 		 86 aa  73.9  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.636504  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0802  ribosomal protein S20  51.16 
 
 		 87 aa  73.2  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.939654  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  55.84 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1576  ribosomal protein S20  52.5 
 
 		 89 aa  72.8  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3262  ribosomal protein S20  56.25 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521997  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  50.59 
 
 		 115 aa  72  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000562255  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1184  ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1919  30S ribosomal protein S20  48.28 
 
 		 99 aa  72.4  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000179184  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  51.72 
 
 		 88 aa  71.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4315  30S ribosomal protein S20  51.25 
 
 		 90 aa  70.9  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000159944  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  54.43 
 
 		 90 aa  70.9  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  50 
 
 		 86 aa  70.5  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  48.24 
 
 		 85 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1755  30S ribosomal protein S20  49.41 
 
 		 91 aa  70.1  0.000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00299182  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 86 aa  70.1  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4233  ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  70.1  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000543427  hitchhiker  0.000000915309 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  48.24 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 85 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1654  ribosomal protein S20  51.72 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.158748  hitchhiker  0.00316633 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1261  30S ribosomal protein S20  51.25 
 
 		 89 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  48.75 
 
 		 86 aa  68.6  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3274  ribosomal protein S20  50 
 
 		 86 aa  68.6  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 85 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 85 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 85 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 85 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 85 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 85 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 85 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 85 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1614  ribosomal protein S20  53.01 
 
 		 88 aa  67.4  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0854  ribosomal protein S20  51.16 
 
 		 86 aa  67.4  0.00000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 87 aa  67  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  45.35 
 
 		 86 aa  67  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  44.71 
 
 		 85 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1556  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 86 aa  66.2  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2207  ribosomal protein S20  50 
 
 		 86 aa  66.6  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.437419  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  53.66 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2835  ribosomal protein S20  40 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.621113 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0490  ribosomal protein S20  47.25 
 
 		 99 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1134  30S ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000567629  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1581  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3035  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 89 aa  65.1  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.051603  normal  0.325405 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1524  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1265  ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 87 aa  65.1  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.15154e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2223  ribosomal protein S20  50 
 
 		 86 aa  65.1  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133967  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0696  ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 86 aa  64.7  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207001  normal  0.0299142 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00027  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000413778  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3575  ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021535  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0023  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000255802  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0026  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000013085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0022  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000378838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0025  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.87642e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3631  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000506786  normal  0.726814 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00026  hypothetical protein  45.98 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000313857  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0027  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000024189  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12430  SSU ribosomal protein S20P  52.33 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0372924  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0047  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000090572  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1172  30S ribosomal protein S20  51.22 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000575412  hitchhiker  0.00000000402538 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1106  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 93 aa  63.9  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00644283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>