258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1902 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1902  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 77 aa  148  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000191113  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0950  30S ribosomal protein S20  84.42 
 
 		 77 aa  124  5e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0608659  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0850  30S ribosomal protein S20  75.32 
 
 		 78 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000116553  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  57.14 
 
 		 89 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  53.57 
 
 		 89 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1583  30S ribosomal protein S20  55.7 
 
 		 83 aa  72.4  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.74402  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0647  30S ribosomal protein S20  54.32 
 
 		 84 aa  71.2  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000292559  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  51.19 
 
 		 85 aa  67  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  48.81 
 
 		 85 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4315  30S ribosomal protein S20  47.44 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000159944  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  48.75 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  45.24 
 
 		 88 aa  62  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1524  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1581  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1172  30S ribosomal protein S20  49.38 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000575412  hitchhiker  0.00000000402538 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1153  30S ribosomal protein S20  47.44 
 
 		 83 aa  61.6  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.320164  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2689  30S ribosomal protein S20  50.6 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2561  30S ribosomal protein S20  50.6 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1643  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 83 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.137149  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1678  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 83 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  44.58 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  43.37 
 
 		 88 aa  60.1  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 95 aa  60.1  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0416  30S ribosomal protein S20  45.78 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000443906  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  43.9 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  50 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2941  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.205918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0490  ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0582  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000160392  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00027  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000413778  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3575  ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021535  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3537  30S ribosomal protein S20  45.78 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0025  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.87642e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0022  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000378838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0023  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000255802  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00026  hypothetical protein  44.58 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000313857  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3631  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000506786  normal  0.726814 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  45.78 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  45.78 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000711095  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0027  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000024189  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  45.78 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000322066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0026  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000013085  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  48.78 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1520  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0696  ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207001  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000408096  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0047  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000090572  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  43.37 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000294185  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1096  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000700681  normal  0.0325702 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0047  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00000872417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0048  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000161385  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1284  SSU ribosomal protein S20P  47.44 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12640  SSU ribosomal protein S20P  42.86 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.464272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  43.37 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0048  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000398649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0047  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000542728  normal  0.0144218 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204572  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  45.78 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  46.99 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00014  30S ribosomal protein S20  43.37 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123306  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  45.78 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  48.75 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3655  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225514  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1019  30S ribosomal protein S20  42.22 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3849  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.716428  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2893  30S ribosomal protein S20  43.37 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204979  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  46.25 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0921  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000253205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  46.75 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  40.96 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  43.04 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  43.75 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3037  ribosomal protein S20p  39.76 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.083141  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  45.57 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  43.37 
 
 		 86 aa  53.5  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  47.37 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000167926  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4205  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.885045 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  43.9 
 
 		 86 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0739  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  42.11 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3590  30S ribosomal protein S20  39.76 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000579115  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3274  ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>