243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf244 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf244  ribosomal protein S20  100 
 
 		 87 aa  168  2e-41  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026073  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  49.38 
 
 		 88 aa  66.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  51.28 
 
 		 86 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  49.37 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  46.75 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2242  30S ribosomal protein S20  49.35 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.636504  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  50.65 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  46.75 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2941  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.205918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  46.48 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0818  30S ribosomal protein S20  43.59 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3079  SSU ribosomal protein S20P  43.68 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0239933  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  46.75 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  39.29 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  43.9 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000591631  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0802  ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.939654  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  41.25 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0527  ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3421  ribosomal protein S20  48.57 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144385  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12430  SSU ribosomal protein S20P  43.53 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0372924  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  43.21 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  43.21 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl368.1  30S ribosomal protein S20  43.59 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.5112799999999996e-45  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  45 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  43.37 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4315  30S ribosomal protein S20  42.5 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000159944  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16091  30S ribosomal protein S20  38.46 
 
 		 100 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 88 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1134  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000567629  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3802  SSU ribosomal protein S20P  40.7 
 
 		 88 aa  51.6  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.042204  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12640  SSU ribosomal protein S20P  48.05 
 
 		 86 aa  51.6  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.464272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 89 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  40.96 
 
 		 86 aa  51.2  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1261  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 89 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 92 aa  50.8  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1520  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_9610  predicted protein  38.75 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.198308  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  37.18 
 
 		 89 aa  50.8  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16781  30S ribosomal protein S20  36.96 
 
 		 97 aa  50.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16671  30S ribosomal protein S20  41.3 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3551  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 89 aa  50.4  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  41.03 
 
 		 162 aa  50.1  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 87 aa  50.4  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2909  30S ribosomal protein S20  45.57 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1018  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.859687  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  37.97 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  40 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0490  ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0854  ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2817  30S ribosomal protein S20  45.57 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18881  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.825907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1654  ribosomal protein S20  47.14 
 
 		 167 aa  48.9  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.158748  hitchhiker  0.00316633 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1919  30S ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000179184  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2069  30S ribosomal protein S20  37.36 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2725  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0313698  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2207  ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.437419  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1846  30S ribosomal protein S20  36.78 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2188  30S ribosomal protein S20  36.78 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220995  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  41.03 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0947  ribosomal protein S20  39.76 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0002  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000000182845  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1019  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2717  30S ribosomal protein S20  45.57 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.469442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5883  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  40.74 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4514  30S ribosomal protein S20  32.94 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  42.31 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2223  ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 86 aa  47.4  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133967  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0850  30S ribosomal protein S20  45 
 
 		 78 aa  47.8  0.00006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000116553  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16911  30S ribosomal protein S20  36.96 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1416  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.719270000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1454  30S ribosomal protein S20  36.9 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0739  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  41.56 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3009  30S ribosomal protein S20  38.1 
 
 		 106 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0094  ribosomal protein S20  39.29 
 
 		 89 aa  47.4  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3274  ribosomal protein S20  34.88 
 
 		 86 aa  47  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  34.12 
 
 		 88 aa  47  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1075  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2512  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0919  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.459642  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0923  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>