More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2297 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2297  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 87 aa  170  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  81.61 
 
 		 87 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  72.41 
 
 		 87 aa  122  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  68.97 
 
 		 87 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0771  30S ribosomal protein S20  72.41 
 
 		 87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0756  30S ribosomal protein S20  72.41 
 
 		 87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000125202  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3131  30S ribosomal protein S20  73.56 
 
 		 87 aa  98.2  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768382  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1416  30S ribosomal protein S20  55.17 
 
 		 87 aa  89  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.719270000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  52.87 
 
 		 91 aa  84  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  53.49 
 
 		 88 aa  82  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  50.57 
 
 		 91 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  52.33 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  51.72 
 
 		 92 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1685  30S ribosomal protein S20  49.43 
 
 		 87 aa  79  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.462249  normal  0.0272644 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 87 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0802  ribosomal protein S20  50 
 
 		 92 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0707  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 92 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0600  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 92 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0646  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 92 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4562  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 92 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0641  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 92 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647122  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 87 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 86 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 88 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3922  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 88 aa  74.7  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4641  30S ribosomal protein S20  49.43 
 
 		 92 aa  73.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647122  hitchhiker  0.00990259 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4370  30S ribosomal protein S20  49.43 
 
 		 92 aa  73.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664055 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  46.51 
 
 		 88 aa  74.3  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 86 aa  73.2  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 88 aa  72.8  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  50 
 
 		 86 aa  72.8  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1013  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 88 aa  72.8  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000773203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 89 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0917  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 89 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1846  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2188  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220995  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 89 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5203  30S ribosomal protein S20  51.72 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.614694  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0001  ribosomal protein S20  49.43 
 
 		 87 aa  70.9  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0152754  hitchhiker  4.7444199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 86 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 86 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 86 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 86 aa  70.5  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  44.83 
 
 		 92 aa  70.5  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 88 aa  70.5  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000591631  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2689  30S ribosomal protein S20  52.5 
 
 		 88 aa  70.1  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2561  30S ribosomal protein S20  52.5 
 
 		 88 aa  70.1  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0741  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 89 aa  69.3  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 95 aa  70.1  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6963  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 88 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1487  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 88 aa  68.2  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.422821  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 89 aa  68.6  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 86 aa  68.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 86 aa  68.2  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 84 aa  68.2  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000167926  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1667  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 88 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00940932  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2207  ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 86 aa  67.8  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.437419  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  48.81 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 89 aa  67.4  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 88 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 88 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000711095  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 88 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000322066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0527  ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 88 aa  67.4  0.00000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3551  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 89 aa  67.4  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  48.81 
 
 		 85 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 88 aa  67  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 88 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3537  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 88 aa  67  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  48.81 
 
 		 85 aa  67  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00027  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000413778  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3575  ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021535  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0001  30S ribosomal protein S20  49.43 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00020529  normal  0.124488 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0022  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000378838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1037  ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3802  SSU ribosomal protein S20P  41.38 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.042204  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2725  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0313698  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0025  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.87642e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1576  ribosomal protein S20  47.5 
 
 		 89 aa  66.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0023  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000255802  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0026  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000013085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3631  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000506786  normal  0.726814 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00026  hypothetical protein  44.83 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000313857  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0027  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000024189  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 85 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 85 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 85 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 85 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 85 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 85 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2223  ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 86 aa  65.5  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133967  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 85 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2909  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2817  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 85 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>