294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0917 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0917  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 89 aa  169  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  70.11 
 
 		 87 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  67.44 
 
 		 87 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  67.82 
 
 		 87 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1685  30S ribosomal protein S20  56.98 
 
 		 87 aa  97.8  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.462249  normal  0.0272644 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0994  30S ribosomal protein S20  56.98 
 
 		 86 aa  88.2  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.945897  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2044  30S ribosomal protein S20  54.65 
 
 		 86 aa  86.7  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0741  30S ribosomal protein S20  48.86 
 
 		 89 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1806  30S ribosomal protein S20  47.73 
 
 		 89 aa  74.7  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0293621  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 86 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1718  30S ribosomal protein S20  47.73 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 87 aa  70.5  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 87 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1783  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1416  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  68.2  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.719270000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0016  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1598  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1965  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3546  30S ribosomal protein S20  43.75 
 
 		 89 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2725  30S ribosomal protein S20  50.63 
 
 		 92 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0313698  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0756  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000125202  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2909  30S ribosomal protein S20  50.63 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4370  30S ribosomal protein S20  47.5 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664055 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4641  30S ribosomal protein S20  47.5 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647122  hitchhiker  0.00990259 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0771  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2817  30S ribosomal protein S20  50.63 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2436  ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000012228  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1619  30S ribosomal protein S20  44.32 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 86 aa  61.6  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  44.3 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0075  ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 91 aa  61.2  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3131  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768382  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  44.71 
 
 		 85 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  44.71 
 
 		 85 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  44.71 
 
 		 85 aa  60.5  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  44.71 
 
 		 85 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  44.71 
 
 		 85 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  44.71 
 
 		 85 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  44.71 
 
 		 85 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  44.71 
 
 		 85 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  43.18 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 89 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3079  SSU ribosomal protein S20P  44.32 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0239933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2297  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  44.19 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2512  30S ribosomal protein S20  43.82 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0377  30S ribosomal protein S20  43.82 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1075  30S ribosomal protein S20  43.82 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0677  30S ribosomal protein S20  43.82 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0735  30S ribosomal protein S20  43.82 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0919  30S ribosomal protein S20  43.82 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.459642  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0923  30S ribosomal protein S20  43.82 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0126  30S ribosomal protein S20  43.82 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  41.38 
 
 		 88 aa  57  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2717  30S ribosomal protein S20  51.9 
 
 		 90 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.469442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0947  ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3104  ribosomal protein S20  40.91 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0196  ribosomal protein S20  43.9 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1261  30S ribosomal protein S20  43.21 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0759  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  43.02 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0001  30S ribosomal protein S20  46.59 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000869567 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3551  30S ribosomal protein S20  43.18 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3203  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  42.17 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0002  30S ribosomal protein S20  40.91 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000000182845  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2556  30S ribosomal protein S20  43.18 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2470  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0125567 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1939  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2575  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2600  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2551  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0745  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.426088 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1037  ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1556  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 86 aa  53.5  0.0000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 86 aa  53.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0531  30S ribosomal protein S20  43.18 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2561  30S ribosomal protein S20  45.57 
 
 		 88 aa  52.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0478  SSU ribosomal protein S20P  43.18 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.075192  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1587  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 88 aa  53.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>