More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1416 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1416  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 87 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.719270000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  59.77 
 
 		 87 aa  98.6  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  57.47 
 
 		 87 aa  97.1  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  57.47 
 
 		 87 aa  96.7  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0771  30S ribosomal protein S20  60.92 
 
 		 87 aa  95.9  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0756  30S ribosomal protein S20  60.92 
 
 		 87 aa  95.9  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000125202  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3131  30S ribosomal protein S20  60.92 
 
 		 87 aa  86.7  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768382  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  52.87 
 
 		 87 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2297  30S ribosomal protein S20  55.17 
 
 		 87 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2436  ribosomal protein S20  51.19 
 
 		 88 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000012228  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2044  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 86 aa  77.4  0.00000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 87 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1718  30S ribosomal protein S20  49.43 
 
 		 88 aa  73.9  0.0000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1685  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.462249  normal  0.0272644 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3551  30S ribosomal protein S20  52.33 
 
 		 89 aa  73.2  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2909  30S ribosomal protein S20  54.43 
 
 		 91 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2817  30S ribosomal protein S20  54.43 
 
 		 91 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2725  30S ribosomal protein S20  53.16 
 
 		 92 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0313698  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 86 aa  70.5  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0917  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 89 aa  68.2  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3546  30S ribosomal protein S20  49.37 
 
 		 89 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3802  SSU ribosomal protein S20P  47.73 
 
 		 88 aa  67  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.042204  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 84 aa  66.6  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000167926  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3922  30S ribosomal protein S20  48.28 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3104  ribosomal protein S20  51.9 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  48.81 
 
 		 85 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6963  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1783  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0016  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1598  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0001  ribosomal protein S20  49.43 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0152754  hitchhiker  4.7444199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0001  30S ribosomal protein S20  48.28 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.714217 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4890  30S ribosomal protein S20  48.28 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.540354  normal  0.302297 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2689  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2561  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1965  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 87 aa  63.5  0.0000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4514  30S ribosomal protein S20  49.37 
 
 		 89 aa  63.5  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2717  30S ribosomal protein S20  50.63 
 
 		 90 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.469442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0001  30S ribosomal protein S20  50.63 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3037  ribosomal protein S20p  46.84 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.083141  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 85 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0196  ribosomal protein S20  48.78 
 
 		 91 aa  62  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0075  ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1806  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 89 aa  62  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0293621  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0741  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0802  ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.939654  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  46.58 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3849  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.716428  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0994  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.945897  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3655  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225514  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 88 aa  60.1  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  48.1 
 
 		 88 aa  60.1  0.000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7677  30S ribosomal protein S20  49.37 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118438  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0001  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  46.84 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  45.57 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0002  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000000182845  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000591631  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1919  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000179184  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3079  SSU ribosomal protein S20P  50.63 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0239933  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2556  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548445  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4641  30S ribosomal protein S20  48.1 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647122  hitchhiker  0.00990259 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4315  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000159944  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4370  30S ribosomal protein S20  48.1 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664055 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  45.57 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0792  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000429038  normal  0.540603 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3590  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000579115  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3031  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.362644  normal  0.541677 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3462  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000449993  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0001  30S ribosomal protein S20  48.28 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000869567 
 
 
-
 
NC_004310  BR2185  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2098  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00199179  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  45.57 
 
 		 90 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2024  ribosomal protein S20  46.25 
 
 		 90 aa  57.4  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000205272  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1556  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 86 aa  57  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0211  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 86 aa  57  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000112504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>