230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0741 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0741  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 89 aa  173  7e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1806  30S ribosomal protein S20  94.38 
 
 		 89 aa  164  4e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0293621  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1783  30S ribosomal protein S20  81.4 
 
 		 87 aa  138  3e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1598  30S ribosomal protein S20  81.4 
 
 		 87 aa  138  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1965  30S ribosomal protein S20  81.4 
 
 		 87 aa  137  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0016  30S ribosomal protein S20  80.23 
 
 		 87 aa  132  9.999999999999999e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1718  30S ribosomal protein S20  78.41 
 
 		 88 aa  131  3e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1619  30S ribosomal protein S20  79.55 
 
 		 88 aa  126  9.000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0075  ribosomal protein S20  76.74 
 
 		 91 aa  120  6e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2044  30S ribosomal protein S20  62.79 
 
 		 86 aa  103  6e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0917  30S ribosomal protein S20  48.86 
 
 		 89 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  51.16 
 
 		 87 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 87 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 86 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  51.16 
 
 		 87 aa  71.2  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0771  30S ribosomal protein S20  52.33 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0756  30S ribosomal protein S20  52.33 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000125202  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 87 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0994  30S ribosomal protein S20  46.67 
 
 		 86 aa  63.9  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.945897  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  40.91 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1685  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.462249  normal  0.0272644 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1416  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.719270000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2725  30S ribosomal protein S20  48.1 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0313698  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  42.7 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6963  30S ribosomal protein S20  43.18 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2817  30S ribosomal protein S20  48.1 
 
 		 91 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3131  30S ribosomal protein S20  54.65 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768382  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  58.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2909  30S ribosomal protein S20  48.1 
 
 		 91 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  45.35 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0700  ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000536683  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0002  30S ribosomal protein S20  40.91 
 
 		 88 aa  57  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000000182845  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1581  30S ribosomal protein S20  40.45 
 
 		 109 aa  57  0.00000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1524  30S ribosomal protein S20  40.45 
 
 		 109 aa  57  0.00000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  41.98 
 
 		 86 aa  57  0.00000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2575  30S ribosomal protein S20  43.82 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0745  30S ribosomal protein S20  43.82 
 
 		 90 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.426088 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  41.57 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1939  30S ribosomal protein S20  43.82 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2600  30S ribosomal protein S20  43.82 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2551  30S ribosomal protein S20  43.82 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4514  30S ribosomal protein S20  39.33 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2470  30S ribosomal protein S20  43.82 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0125567 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2436  ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000012228  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1037  ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7677  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118438  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3104  ribosomal protein S20  40.45 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5883  30S ribosomal protein S20  42.7 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0001  ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0152754  hitchhiker  4.7444199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000591631  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0377  30S ribosomal protein S20  40.91 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1075  30S ribosomal protein S20  40.91 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0735  30S ribosomal protein S20  40.91 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0677  30S ribosomal protein S20  40.91 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2512  30S ribosomal protein S20  40.91 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0919  30S ribosomal protein S20  40.91 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.459642  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0923  30S ribosomal protein S20  40.91 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0126  30S ribosomal protein S20  40.91 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  42.7 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0792  ribosomal protein S20  41.25 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2765  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3802  SSU ribosomal protein S20P  35.23 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.042204  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0531  30S ribosomal protein S20  40.91 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4370  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664055 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4641  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647122  hitchhiker  0.00990259 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1487  30S ribosomal protein S20  40.91 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.422821  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0094  ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0802  ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 87 aa  53.5  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.939654  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 94 aa  52.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  39.33 
 
 		 89 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  43.37 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  40.45 
 
 		 84 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000167926  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3203  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  39.77 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2185  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1471  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2098  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00199179  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3922  30S ribosomal protein S20  36.05 
 
 		 88 aa  51.6  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0390  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 		 88 aa  51.2  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0001  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 		 88 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0527  ribosomal protein S20  42.39 
 
 		 88 aa  51.2  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1667  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00940932  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2904  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.871002 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000294185  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000408096  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204572  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2024  ribosomal protein S20  40.45 
 
 		 90 aa  50.8  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000205272  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0001  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 		 88 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.714217 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2301  ribosomal protein S20  41.57 
 
 		 88 aa  50.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4890  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 		 88 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.540354  normal  0.302297 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0759  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 		 92 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  39.77 
 
 		 88 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  39.77 
 
 		 88 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000711095  normal  0.679659 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>