219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1806 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1806  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 89 aa  172  9.999999999999999e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0293621  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0741  30S ribosomal protein S20  94.38 
 
 		 89 aa  164  4e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1783  30S ribosomal protein S20  83.72 
 
 		 87 aa  139  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1598  30S ribosomal protein S20  83.72 
 
 		 87 aa  139  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1965  30S ribosomal protein S20  82.56 
 
 		 87 aa  137  6e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1718  30S ribosomal protein S20  79.55 
 
 		 88 aa  135  2e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0016  30S ribosomal protein S20  81.4 
 
 		 87 aa  132  9.999999999999999e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1619  30S ribosomal protein S20  78.41 
 
 		 88 aa  123  8.000000000000001e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0075  ribosomal protein S20  75.58 
 
 		 91 aa  116  9e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2044  30S ribosomal protein S20  62.79 
 
 		 86 aa  102  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0917  30S ribosomal protein S20  47.73 
 
 		 89 aa  74.7  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  51.16 
 
 		 87 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 86 aa  67  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0771  30S ribosomal protein S20  52.33 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0756  30S ribosomal protein S20  52.33 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000125202  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0994  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 86 aa  63.5  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.945897  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 87 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1416  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 87 aa  62  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.719270000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  42.7 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  39.77 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1685  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.462249  normal  0.0272644 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1581  30S ribosomal protein S20  42.7 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1524  30S ribosomal protein S20  42.7 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  41.98 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3131  30S ribosomal protein S20  52.33 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768382  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2817  30S ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000591631  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2909  30S ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  41.86 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0002  30S ribosomal protein S20  40.91 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000000182845  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2436  ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000012228  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3802  SSU ribosomal protein S20P  35.23 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.042204  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  39.33 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2470  30S ribosomal protein S20  42.7 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0125567 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0745  30S ribosomal protein S20  42.7 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.426088 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2725  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0313698  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1939  30S ribosomal protein S20  42.7 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2575  30S ribosomal protein S20  42.7 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2600  30S ribosomal protein S20  42.7 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2551  30S ribosomal protein S20  42.7 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1487  30S ribosomal protein S20  40.91 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.422821  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0792  ribosomal protein S20  42.5 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0802  ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 87 aa  53.5  0.0000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.939654  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5883  30S ribosomal protein S20  41.57 
 
 		 90 aa  52.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  42.05 
 
 		 88 aa  53.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0001  ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0152754  hitchhiker  4.7444199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0377  30S ribosomal protein S20  39.77 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2765  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1075  30S ribosomal protein S20  39.77 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0735  30S ribosomal protein S20  39.77 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1667  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00940932  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0700  ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000536683  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0677  30S ribosomal protein S20  39.77 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2512  30S ribosomal protein S20  39.77 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0919  30S ribosomal protein S20  39.77 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.459642  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0923  30S ribosomal protein S20  39.77 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0126  30S ribosomal protein S20  39.77 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  37.08 
 
 		 89 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  42.17 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  39.77 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4514  30S ribosomal protein S20  37.08 
 
 		 89 aa  51.2  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3104  ribosomal protein S20  38.2 
 
 		 90 aa  51.6  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6963  30S ribosomal protein S20  39.77 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1037  ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 87 aa  50.8  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0527  ribosomal protein S20  42.39 
 
 		 88 aa  50.8  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0094  ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 89 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0531  30S ribosomal protein S20  39.77 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2098  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 		 105 aa  50.4  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00199179  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2185  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 		 88 aa  50.4  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3203  30S ribosomal protein S20  37.5 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2904  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.871002 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  38.2 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000167926  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1471  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7677  30S ribosomal protein S20  39.77 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118438  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3922  30S ribosomal protein S20  34.88 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000294185  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  40.45 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2301  ribosomal protein S20  40.45 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3079  SSU ribosomal protein S20P  36.36 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0239933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  38.2 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000408096  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204572  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4641  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647122  hitchhiker  0.00990259 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4370  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0001  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2893  30S ribosomal protein S20  37.97 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204979  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0921  30S ribosomal protein S20  37.5 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000253205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00014  30S ribosomal protein S20  44.94 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123306  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  38.2 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>