225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1619 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1619  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 88 aa  173  8e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0741  30S ribosomal protein S20  79.55 
 
 		 89 aa  140  6e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1718  30S ribosomal protein S20  80.68 
 
 		 88 aa  137  3e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1806  30S ribosomal protein S20  78.41 
 
 		 89 aa  137  3.9999999999999997e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0293621  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0016  30S ribosomal protein S20  72.09 
 
 		 87 aa  123  7e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1783  30S ribosomal protein S20  70.93 
 
 		 87 aa  122  2e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1598  30S ribosomal protein S20  70.93 
 
 		 87 aa  122  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1965  30S ribosomal protein S20  70.93 
 
 		 87 aa  120  5e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0075  ribosomal protein S20  73.26 
 
 		 91 aa  116  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2044  30S ribosomal protein S20  56.98 
 
 		 86 aa  98.6  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  51.16 
 
 		 87 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 87 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0771  30S ribosomal protein S20  53.49 
 
 		 87 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0756  30S ribosomal protein S20  53.49 
 
 		 87 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000125202  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 86 aa  67.8  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0917  30S ribosomal protein S20  44.32 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  44.32 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0994  30S ribosomal protein S20  46.25 
 
 		 86 aa  63.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.945897  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1685  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.462249  normal  0.0272644 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2436  ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000012228  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1416  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.719270000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3802  SSU ribosomal protein S20P  38.64 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.042204  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3104  ribosomal protein S20  42.05 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2098  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00199179  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2185  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1524  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1581  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3131  30S ribosomal protein S20  51.16 
 
 		 87 aa  57  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768382  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 88 aa  57  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000591631  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0002  30S ribosomal protein S20  40.91 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000000182845  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  40.91 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7677  30S ribosomal protein S20  43.18 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118438  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6963  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2817  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2909  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0390  30S ribosomal protein S20  44.32 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0700  ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000536683  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2725  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0313698  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3546  30S ribosomal protein S20  42.5 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4370  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664055 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4641  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647122  hitchhiker  0.00990259 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  40.51 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4514  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0527  ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  39.53 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0001  30S ribosomal protein S20  40.91 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3922  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0001  ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0152754  hitchhiker  4.7444199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  39.77 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0001  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 		 88 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.714217 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1037  ribosomal protein S20  34.88 
 
 		 87 aa  51.6  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4890  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 		 88 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.540354  normal  0.302297 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0001  30S ribosomal protein S20  39.77 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 		 89 aa  51.2  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0001  30S ribosomal protein S20  43.18 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000869567 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  36.05 
 
 		 91 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2765  30S ribosomal protein S20  35.23 
 
 		 88 aa  50.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3031  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 87 aa  50.8  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.362644  normal  0.541677 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0792  ribosomal protein S20  38.75 
 
 		 87 aa  50.1  0.000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3079  SSU ribosomal protein S20P  38.64 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0239933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  37.08 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000167926  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0094  ribosomal protein S20  39.24 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  37.5 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  42.17 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3551  30S ribosomal protein S20  34.09 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1667  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 		 88 aa  49.7  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00940932  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0696  ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207001  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1281  30S ribosomal protein S20  36.36 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000755686  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2678  30S ribosomal protein S20  35.23 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.855392  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  36.36 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1471  30S ribosomal protein S20  35.23 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2301  ribosomal protein S20  43.18 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1756  30S ribosomal protein S20  35.23 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.443874  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  34.88 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1487  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.422821  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  41.86 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4212  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1013  30S ribosomal protein S20  37.5 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000773203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4421  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 88 aa  47.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1517  SSU ribosomal protein S20P  36.62 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.256049  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2904  30S ribosomal protein S20  35.23 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.871002 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0802  ribosomal protein S20  34.88 
 
 		 92 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0707  30S ribosomal protein S20  34.88 
 
 		 92 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0492  ribosomal protein S20  37.97 
 
 		 87 aa  47.4  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.131868  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4102  SSU ribosomal protein S20P  41.86 
 
 		 88 aa  47.8  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0859  30S ribosomal protein S20  38.89 
 
 		 89 aa  47.4  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000132311  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  37.97 
 
 		 92 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0641  30S ribosomal protein S20  34.88 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647122  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_002978  WD1150  30S ribosomal protein S20  32.18 
 
 		 89 aa  47.4  0.00007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  hitchhiker  0.00399464  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0646  30S ribosomal protein S20  34.88 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0531  30S ribosomal protein S20  36.36 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>