More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2067 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  100 
 
 
88 aa  171  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  59.09 
 
 
88 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  58.14 
 
 
88 aa  97.8  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  55.68 
 
 
88 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  52.33 
 
 
95 aa  90.1  9e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  52.33 
 
 
94 aa  83.2  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1576  ribosomal protein S20  59.76 
 
 
89 aa  82.8  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  52.38 
 
 
87 aa  82  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  52.38 
 
 
87 aa  82  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  51.25 
 
 
105 aa  80.9  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4315  30S ribosomal protein S20  53.01 
 
 
90 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000159944  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  51.16 
 
 
87 aa  76.6  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 
87 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  48.86 
 
 
89 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  50 
 
 
89 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 
87 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  51.16 
 
 
86 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1281  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 
88 aa  73.6  0.0000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000755686  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  48.78 
 
 
86 aa  73.2  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  51.19 
 
 
86 aa  72  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  48.84 
 
 
86 aa  72  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  47.73 
 
 
88 aa  71.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  46.51 
 
 
87 aa  71.2  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  50 
 
 
86 aa  71.2  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 
87 aa  70.9  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 
86 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1919  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 
99 aa  69.3  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000179184  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 
86 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 
86 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1587  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 
88 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 
86 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  47.62 
 
 
86 aa  68.2  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2242  30S ribosomal protein S20  51.16 
 
 
86 aa  67.8  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.636504  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  48.78 
 
 
86 aa  67.8  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2223  ribosomal protein S20  52.38 
 
 
86 aa  67.4  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133967  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 
88 aa  67  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4514  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 
89 aa  67  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  50.65 
 
 
151 aa  66.6  0.00000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0756  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 
87 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000125202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0771  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 
87 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  47.13 
 
 
162 aa  65.9  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3922  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 
88 aa  65.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  47.62 
 
 
92 aa  65.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0001  ribosomal protein S20  41.38 
 
 
87 aa  65.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0152754  hitchhiker  4.7444199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  42.86 
 
 
88 aa  65.1  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000591631  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 
86 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  40.91 
 
 
88 aa  64.7  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12640  SSU ribosomal protein S20P  50 
 
 
86 aa  64.7  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.464272  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  46.43 
 
 
86 aa  64.3  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1261  30S ribosomal protein S20  49.38 
 
 
89 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  41.67 
 
 
115 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000562255  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  42.86 
 
 
89 aa  63.9  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  45.35 
 
 
86 aa  63.5  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0802  ribosomal protein S20  46.51 
 
 
87 aa  62.8  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.939654  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_002978  WD1150  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 
89 aa  63.2  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  hitchhiker  0.00399464  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  50.65 
 
 
95 aa  63.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  47.56 
 
 
88 aa  62.8  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  47.56 
 
 
88 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3421  ribosomal protein S20  49.33 
 
 
86 aa  62.8  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144385  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_004310  BR2185  30S ribosomal protein S20  39.77 
 
 
88 aa  62.4  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  48.15 
 
 
107 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4205  30S ribosomal protein S20  39.78 
 
 
97 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.885045 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2297  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 
87 aa  62.4  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1520  30S ribosomal protein S20  41.3 
 
 
98 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2098  30S ribosomal protein S20  39.77 
 
 
105 aa  62.4  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00199179  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 
86 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6963  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
88 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  44.71 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1184  ribosomal protein S20  40.91 
 
 
88 aa  62.4  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 
85 aa  62  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 
87 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0002  30S ribosomal protein S20  41.46 
 
 
88 aa  61.6  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000000182845  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3802  SSU ribosomal protein S20P  38.37 
 
 
88 aa  61.6  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.042204  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3262  ribosomal protein S20  48.78 
 
 
90 aa  62  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521997  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2207  ribosomal protein S20  48.81 
 
 
86 aa  61.6  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.437419  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
87 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  47.06 
 
 
85 aa  60.8  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 
85 aa  60.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  43.04 
 
 
86 aa  60.8  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  39.77 
 
 
88 aa  60.8  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  44.05 
 
 
89 aa  60.8  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3188  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
87 aa  60.8  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0921444 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1487  30S ribosomal protein S20  41.98 
 
 
88 aa  60.1  0.000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.422821  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0290  ribosomal protein S20  46.88 
 
 
73 aa  60.1  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000431613  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1667  30S ribosomal protein S20  41.98 
 
 
88 aa  60.1  0.000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00940932  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4641  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 
92 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647122  hitchhiker  0.00990259 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1019  30S ribosomal protein S20  37.78 
 
 
116 aa  60.1  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0854  ribosomal protein S20  44.19 
 
 
86 aa  60.1  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3546  30S ribosomal protein S20  40 
 
 
89 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4370  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 
92 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664055 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 
85 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 
85 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 
85 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1846  30S ribosomal protein S20  43.37 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2188  30S ribosomal protein S20  43.37 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 
85 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 
85 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 
85 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0947  ribosomal protein S20  43.21 
 
 
100 aa  59.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  45.12 
 
 
94 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>