285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7677 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7677  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 88 aa  168  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118438  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6963  30S ribosomal protein S20  94.32 
 
 		 88 aa  159  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0001  30S ribosomal protein S20  87.5 
 
 		 88 aa  148  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.714217 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4890  30S ribosomal protein S20  87.5 
 
 		 88 aa  148  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.540354  normal  0.302297 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0001  30S ribosomal protein S20  87.5 
 
 		 88 aa  147  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0001  30S ribosomal protein S20  86.36 
 
 		 88 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3922  30S ribosomal protein S20  74.42 
 
 		 88 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0001  ribosomal protein S20  73.26 
 
 		 87 aa  124  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0152754  hitchhiker  4.7444199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4370  30S ribosomal protein S20  72.09 
 
 		 92 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664055 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4641  30S ribosomal protein S20  72.09 
 
 		 92 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647122  hitchhiker  0.00990259 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0002  30S ribosomal protein S20  69.32 
 
 		 88 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000000182845  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2185  30S ribosomal protein S20  68.18 
 
 		 88 aa  116  7.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2098  30S ribosomal protein S20  68.18 
 
 		 105 aa  116  9e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00199179  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0390  30S ribosomal protein S20  73.86 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0001  30S ribosomal protein S20  72.73 
 
 		 88 aa  114  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000869567 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3079  SSU ribosomal protein S20P  68.18 
 
 		 88 aa  114  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0239933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4102  SSU ribosomal protein S20P  70.45 
 
 		 88 aa  113  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1281  30S ribosomal protein S20  63.64 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000755686  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4514  30S ribosomal protein S20  65.12 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  64.77 
 
 		 88 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0001  30S ribosomal protein S20  77.91 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00020529  normal  0.124488 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4421  30S ribosomal protein S20  67.44 
 
 		 88 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4712  30S ribosomal protein S20  67.44 
 
 		 88 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.822452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3143  30S ribosomal protein S20  66.28 
 
 		 88 aa  107  6e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4943  30S ribosomal protein S20  65.12 
 
 		 88 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3031  30S ribosomal protein S20  68.6 
 
 		 87 aa  103  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.362644  normal  0.541677 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4039  30S ribosomal protein S20  63.95 
 
 		 88 aa  103  8e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5323  30S ribosomal protein S20  68.35 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.761405  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7874  30S ribosomal protein S20  60.47 
 
 		 88 aa  100  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1341  30S ribosomal protein S20  59.3 
 
 		 92 aa  97.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0010  30S ribosomal protein S20  59.3 
 
 		 92 aa  97.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3551  30S ribosomal protein S20  57.95 
 
 		 89 aa  96.7  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4212  30S ribosomal protein S20  62.5 
 
 		 88 aa  94  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0001  30S ribosomal protein S20  60.47 
 
 		 92 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.000133909  decreased coverage  0.0000000319383 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0792  ribosomal protein S20  56.98 
 
 		 87 aa  93.2  1e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3104  ribosomal protein S20  56.82 
 
 		 90 aa  90.9  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3802  SSU ribosomal protein S20P  55.68 
 
 		 88 aa  90.1  9e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.042204  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1150  30S ribosomal protein S20  52.33 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  hitchhiker  0.00399464  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5079  30S ribosomal protein S20  63.22 
 
 		 91 aa  86.3  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4886  30S ribosomal protein S20  56.98 
 
 		 87 aa  84  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.222256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1690  30S ribosomal protein S20  69.32 
 
 		 89 aa  80.5  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000410806  hitchhiker  0.0000000528048 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  49.43 
 
 		 87 aa  75.1  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3188  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 87 aa  72.4  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0921444 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0071  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2725  30S ribosomal protein S20  50.63 
 
 		 92 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0313698  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  47.67 
 
 		 92 aa  71.2  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3655  30S ribosomal protein S20  48.28 
 
 		 87 aa  71.2  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225514  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3849  30S ribosomal protein S20  48.28 
 
 		 87 aa  71.2  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.716428  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1013  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000773203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3546  30S ribosomal protein S20  50.59 
 
 		 89 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 87 aa  70.5  0.000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2909  30S ribosomal protein S20  50.63 
 
 		 91 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2817  30S ribosomal protein S20  50.63 
 
 		 91 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 88 aa  69.3  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 92 aa  69.3  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0041  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 95 aa  69.7  0.00000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.418613  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4233  ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000543427  hitchhiker  0.000000915309 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3338  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  46.59 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  46.59 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000711095  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  45.45 
 
 		 88 aa  69.3  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  46.59 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000322066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3590  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000579115  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0792  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000429038  normal  0.540603 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  48.86 
 
 		 90 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3462  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000449993  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 91 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3537  30S ribosomal protein S20  46.59 
 
 		 88 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0696  ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 86 aa  67.8  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207001  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 88 aa  67.4  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3037  ribosomal protein S20p  44.19 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.083141  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1096  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 88 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000700681  normal  0.0325702 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0921  30S ribosomal protein S20  46.59 
 
 		 88 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000253205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 88 aa  67  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 88 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000408096  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 88 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000294185  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 88 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204572  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 88 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0600  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1846  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 91 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0641  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647122  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1487  30S ribosomal protein S20  44.32 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.422821  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4562  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2188  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 91 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220995  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0646  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0802  ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0707  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2893  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204979  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 86 aa  66.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004422  SSU ribosomal protein S20p  48.84 
 
 		 86 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000816133  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 86 aa  64.3  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0047  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000090572  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0048  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000161385  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0047  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00000872417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0047  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000542728  normal  0.0144218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0048  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000398649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2726  30S ribosomal protein S20  46.59 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000316732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>