184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2301 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2301  ribosomal protein S20  100 
 
 		 88 aa  170  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  44.87 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3546  30S ribosomal protein S20  45.57 
 
 		 89 aa  57  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2909  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2817  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2069  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1576  ribosomal protein S20  39.02 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0947  ribosomal protein S20  43.21 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2725  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0313698  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  41.1 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1106  30S ribosomal protein S20  37.08 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00644283  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0603  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 98 aa  52  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  47.14 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  41.57 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  43.37 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1416  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.719270000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000167926  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0527  ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  38.2 
 
 		 91 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3551  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 89 aa  50.4  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0741  30S ribosomal protein S20  41.57 
 
 		 89 aa  50.8  0.000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0819  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 84 aa  50.4  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  39.76 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01050  30S ribosomal protein S20  39.29 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  39.76 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  39.24 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1806  30S ribosomal protein S20  40.45 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0293621  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1487  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.422821  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1854  SSU ribosomal protein S20P  38.82 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3802  SSU ribosomal protein S20P  43.04 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.042204  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1667  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00940932  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1019  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 88 aa  48.1  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000591631  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0600  30S ribosomal protein S20  38.2 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1520  30S ribosomal protein S20  39.77 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1037  ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  39.24 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  39.24 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0646  30S ribosomal protein S20  38.2 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1134  30S ribosomal protein S20  37.65 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000567629  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0641  30S ribosomal protein S20  38.2 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647122  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4562  30S ribosomal protein S20  38.2 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1013  30S ribosomal protein S20  39.24 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000773203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  40 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  39.76 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 87 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  44.71 
 
 		 88 aa  47.8  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 89 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  39.73 
 
 		 92 aa  47  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1018  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 98 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.859687  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18881  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 98 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.825907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0647  30S ribosomal protein S20  44.59 
 
 		 84 aa  47  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000292559  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0802  ribosomal protein S20  38.55 
 
 		 92 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0707  30S ribosomal protein S20  38.55 
 
 		 92 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1846  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3035  30S ribosomal protein S20  39.24 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.051603  normal  0.325405 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5883  30S ribosomal protein S20  42.22 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2188  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220995  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04341  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  36.36 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1685  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.462249  normal  0.0272644 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4938  30S ribosomal protein S20  40.96 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0745  30S ribosomal protein S20  40.45 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.426088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1753  30S ribosomal protein S20  40.62 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf244  ribosomal protein S20  36.59 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026073  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1780  30S ribosomal protein S20  40.62 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2941  30S ribosomal protein S20  37.5 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.205918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0196  ribosomal protein S20  41.25 
 
 		 91 aa  45.4  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0100  30S ribosomal protein S20  30.12 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  30.59 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000562255  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16091  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0377  30S ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1075  30S ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0818  30S ribosomal protein S20  36.71 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0735  30S ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2024  ribosomal protein S20  38.55 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000205272  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  34.52 
 
 		 88 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0677  30S ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2512  30S ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0919  30S ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.459642  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0923  30S ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0126  30S ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  38.36 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5203  30S ribosomal protein S20  37.08 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.614694  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1153  30S ribosomal protein S20  35.44 
 
 		 83 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.320164  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  41.46 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4205  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.885045 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1939  30S ribosomal protein S20  39.33 
 
 		 90 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2600  30S ribosomal protein S20  39.33 
 
 		 90 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2551  30S ribosomal protein S20  39.33 
 
 		 90 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0859  30S ribosomal protein S20  38.2 
 
 		 89 aa  44.3  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000132311  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2575  30S ribosomal protein S20  39.33 
 
 		 90 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>