237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_2044 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_2044  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 86 aa  168  2e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1718  30S ribosomal protein S20  61.63 
 
 		 88 aa  105  3e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0741  30S ribosomal protein S20  62.79 
 
 		 89 aa  103  6e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1806  30S ribosomal protein S20  62.79 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0293621  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0016  30S ribosomal protein S20  62.79 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1783  30S ribosomal protein S20  60.47 
 
 		 87 aa  97.8  5e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1598  30S ribosomal protein S20  60.47 
 
 		 87 aa  97.8  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1965  30S ribosomal protein S20  60.47 
 
 		 87 aa  96.7  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1619  30S ribosomal protein S20  56.98 
 
 		 88 aa  91.7  3e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0075  ribosomal protein S20  55.81 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  53.49 
 
 		 87 aa  88.2  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0917  30S ribosomal protein S20  54.65 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 87 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1416  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 87 aa  77.4  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.719270000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 87 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2436  ribosomal protein S20  48.24 
 
 		 88 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000012228  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3104  ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 90 aa  72.8  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3802  SSU ribosomal protein S20P  46.51 
 
 		 88 aa  68.2  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.042204  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1685  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.462249  normal  0.0272644 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 86 aa  67.8  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0994  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 86 aa  65.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.945897  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3551  30S ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 89 aa  63.9  0.0000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 84 aa  60.8  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000167926  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0771  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0756  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000125202  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000591631  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4514  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0002  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000000182845  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0527  ribosomal protein S20  45.56 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2098  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00199179  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2185  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3188  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  57  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0921444 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  41.86 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3131  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768382  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  39.24 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  40.51 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2725  30S ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0313698  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0792  ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3546  30S ribosomal protein S20  39.24 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1517  SSU ribosomal protein S20P  42.31 
 
 		 84 aa  55.1  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.256049  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2909  30S ribosomal protein S20  48.1 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2817  30S ribosomal protein S20  48.1 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1524  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1581  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1281  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000755686  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0001  ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0152754  hitchhiker  4.7444199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  39.29 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  52.8  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  52.8  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1150  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  hitchhiker  0.00399464  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6963  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 85 aa  52.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3079  SSU ribosomal protein S20P  39.24 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0239933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2556  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000294185  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0071  30S ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000408096  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2024  ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000205272  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204572  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 88 aa  51.2  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4370  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664055 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4641  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647122  hitchhiker  0.00990259 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0001  30S ribosomal protein S20  34.88 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0041  30S ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.418613  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  45.21 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3421  ribosomal protein S20  41.1 
 
 		 86 aa  50.4  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144385  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3922  30S ribosomal protein S20  33.72 
 
 		 88 aa  50.4  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  37.8 
 
 		 87 aa  50.4  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0001  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 88 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 88 aa  50.1  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1648  ribosomal protein S20  39.73 
 
 		 87 aa  50.1  0.000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.407525 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0802  ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.939654  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1341  30S ribosomal protein S20  42.68 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1556  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3031  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.362644  normal  0.541677 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2223  ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133967  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4886  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.222256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0010  30S ribosomal protein S20  42.68 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0001  30S ribosomal protein S20  36.05 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.714217 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  43.53 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2765  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4102  SSU ribosomal protein S20P  38.37 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2717  30S ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.469442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000562255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>