183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1172 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1172  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 88 aa  166  1e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000575412  hitchhiker  0.00000000402538 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0647  30S ribosomal protein S20  54.22 
 
 		 84 aa  79.3  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000292559  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4315  30S ribosomal protein S20  53.01 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000159944  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1583  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 83 aa  72.8  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.74402  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  51.22 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  53.57 
 
 		 86 aa  63.9  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  51.22 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  51.22 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  48.78 
 
 		 89 aa  63.5  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  46.34 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  51.85 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1153  30S ribosomal protein S20  47.44 
 
 		 83 aa  62.8  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.320164  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1902  30S ribosomal protein S20  49.38 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000191113  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  47.56 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  50.6 
 
 		 86 aa  61.6  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0850  30S ribosomal protein S20  49.41 
 
 		 78 aa  61.2  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000116553  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0950  30S ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 77 aa  60.8  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0608659  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  51.95 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1643  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 83 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.137149  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1678  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 83 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1524  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  46.34 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1581  30S ribosomal protein S20  51.9 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  46.59 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  44.71 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  48.81 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  43.9 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  47.56 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  49.38 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  46.34 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3262  ribosomal protein S20  48.81 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521997  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12640  SSU ribosomal protein S20P  45.12 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.464272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  45 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  46.25 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1284  SSU ribosomal protein S20P  42.5 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  46.91 
 
 		 86 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 87 aa  53.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0802  ribosomal protein S20  45.78 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.939654  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  43.21 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  41.46 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  48.15 
 
 		 86 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1614  ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  48.15 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1576  ribosomal protein S20  41.56 
 
 		 89 aa  51.6  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  46.34 
 
 		 85 aa  51.6  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  43.9 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  38.75 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000562255  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  44.16 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  45.12 
 
 		 85 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  44.71 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00014  30S ribosomal protein S20  43.75 
 
 		 89 aa  50.8  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123306  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1122  30S ribosomal protein S20  45 
 
 		 89 aa  50.4  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.453734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3570  30S ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 103 aa  50.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3274  ribosomal protein S20  45.12 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2242  30S ribosomal protein S20  48.78 
 
 		 86 aa  50.1  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.636504  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  43.9 
 
 		 85 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2181  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 97 aa  50.4  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752642  normal  0.564535 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2689  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2561  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2223  ribosomal protein S20  49.38 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133967  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  43.9 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  43.9 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  43.9 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  43.9 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  43.9 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  43.9 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  43.9 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2207  ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.437419  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1261  30S ribosomal protein S20  46.59 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  46.91 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  43.9 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1134  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000567629  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  45.57 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0771  30S ribosomal protein S20  40.74 
 
 		 87 aa  48.9  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3009  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0756  30S ribosomal protein S20  40.74 
 
 		 87 aa  48.9  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000125202  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3000  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.468809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1454  30S ribosomal protein S20  43.21 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2427  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2122  30S ribosomal protein S20  41.98 
 
 		 100 aa  47.8  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00639471  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1556  30S ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3546  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 89 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  44.44 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  39.02 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3421  ribosomal protein S20  47.22 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144385  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  42.68 
 
 		 94 aa  47  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  48.75 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl368.1  30S ribosomal protein S20  43.59 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.5112799999999996e-45  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0531  30S ribosomal protein S20  43.06 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>