More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_12880 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  100 
 
 		 87 aa  167  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  55.17 
 
 		 88 aa  93.2  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  52.87 
 
 		 88 aa  88.2  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  50 
 
 		 95 aa  83.6  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  51.72 
 
 		 88 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  51.72 
 
 		 87 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  51.72 
 
 		 87 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  48.24 
 
 		 105 aa  80.1  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 89 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 94 aa  74.7  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 89 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0700  ribosomal protein S20  49.35 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000536683  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 85 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 85 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 85 aa  72  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 85 aa  72  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 85 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 85 aa  72  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1919  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000179184  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 85 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 85 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 88 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 85 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 85 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 85 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 86 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  44.19 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1576  ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 89 aa  68.6  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4315  30S ribosomal protein S20  44.71 
 
 		 90 aa  68.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000159944  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0320  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 91 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  45.12 
 
 		 86 aa  67.8  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  48.1 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1639  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 88 aa  67.4  0.00000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000663879  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1521  ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 88 aa  67.4  0.00000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000787873  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0456  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 93 aa  67  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  45.12 
 
 		 88 aa  66.6  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 86 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 86 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0802  ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.939654  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 86 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 89 aa  65.5  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  43.9 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1383  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000140868  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 86 aa  65.5  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1106  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 93 aa  64.3  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00644283  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0424  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 91 aa  64.3  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000562255  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1587  30S ribosomal protein S20  39.76 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0856  ribosomal protein S20  41.57 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.819382  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00027  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000413778  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3575  ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021535  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0022  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000378838  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 92 aa  63.5  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00026  hypothetical protein  42.53 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000313857  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1261  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 89 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1184  ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0025  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.87642e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1755  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00299182  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0027  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000024189  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0023  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000255802  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 86 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0026  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000013085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 86 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3631  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000506786  normal  0.726814 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  45.57 
 
 		 90 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0696  ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207001  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 90 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  41.25 
 
 		 91 aa  62  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0047  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00000872417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 85 aa  62  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 87 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1134  30S ribosomal protein S20  44.71 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000567629  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0047  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000542728  normal  0.0144218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0047  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000090572  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0048  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000161385  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  38.55 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  42.86 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0048  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000398649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0582  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000160392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3655  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225514  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1846  30S ribosomal protein S20  38.75 
 
 		 91 aa  61.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3849  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.716428  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2188  30S ribosomal protein S20  38.75 
 
 		 91 aa  61.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220995  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 86 aa  60.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  43.9 
 
 		 87 aa  60.1  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1723  30S ribosomal protein S20  41.46 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3462  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000449993  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3590  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000579115  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0792  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000429038  normal  0.540603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>