284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1184 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1184  ribosomal protein S20  100 
 
 		 88 aa  166  7e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  52.38 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  48.84 
 
 		 88 aa  73.2  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 87 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 87 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  48.86 
 
 		 89 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0739  30S ribosomal protein S20  47.42 
 
 		 97 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 86 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  47.73 
 
 		 89 aa  67.8  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 86 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 86 aa  66.2  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1919  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000179184  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0527  ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 88 aa  66.6  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  46.51 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  40.91 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 94 aa  63.5  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  45.68 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  48.15 
 
 		 88 aa  62  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  40.91 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1780  30S ribosomal protein S20  43.3 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1753  30S ribosomal protein S20  43.3 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  50 
 
 		 85 aa  62  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  48.15 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3421  ribosomal protein S20  47.95 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144385  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0490  ribosomal protein S20  45.83 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  43.18 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 86 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 86 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 86 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1520  30S ribosomal protein S20  42.11 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3551  30S ribosomal protein S20  41.25 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 89 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000591631  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1281  30S ribosomal protein S20  37.5 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000755686  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000562255  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1106  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00644283  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2098  30S ribosomal protein S20  40.45 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00199179  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3188  30S ribosomal protein S20  44.94 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0921444 
 
 
-
 
NC_004310  BR2185  30S ribosomal protein S20  40.45 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0802  ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 87 aa  57  0.00000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.939654  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  40.91 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1487  30S ribosomal protein S20  41.76 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.422821  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0002  30S ribosomal protein S20  41.46 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000000182845  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2941  30S ribosomal protein S20  40.66 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.205918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4315  30S ribosomal protein S20  39.51 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000159944  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1019  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1261  30S ribosomal protein S20  41.98 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1667  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00940932  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  40.91 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3922  30S ribosomal protein S20  38.75 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2069  30S ribosomal protein S20  41.24 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  43.21 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1341  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0010  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3262  ribosomal protein S20  46.91 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521997  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04341  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0947  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000396831  normal  0.19884 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 		 87 aa  53.5  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  43.84 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1018  30S ribosomal protein S20  41.94 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.859687  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4233  ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000543427  hitchhiker  0.000000915309 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2223  ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133967  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18881  30S ribosomal protein S20  41.94 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.825907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  42.47 
 
 		 151 aa  52.8  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  38.37 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0071  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  42.5 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2242  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 86 aa  52  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.636504  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  39.24 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1587  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1576  ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 89 aa  51.6  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4205  30S ribosomal protein S20  35.48 
 
 		 97 aa  51.2  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.885045 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1556  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 86 aa  51.2  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4370  30S ribosomal protein S20  39.51 
 
 		 92 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664055 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 162 aa  51.2  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4641  30S ribosomal protein S20  39.51 
 
 		 92 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647122  hitchhiker  0.00990259 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1902  30S ribosomal protein S20  38.1 
 
 		 77 aa  51.2  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000191113  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 86 aa  51.2  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>