214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1520 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1520  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 98 aa  196  7.999999999999999e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1019  30S ribosomal protein S20  73.56 
 
 		 116 aa  127  5.0000000000000004e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2941  30S ribosomal protein S20  63.83 
 
 		 112 aa  124  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.205918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0490  ribosomal protein S20  70.33 
 
 		 99 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0739  30S ribosomal protein S20  67.78 
 
 		 97 aa  120  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4205  30S ribosomal protein S20  66.67 
 
 		 97 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.885045 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04341  30S ribosomal protein S20  58.33 
 
 		 100 aa  113  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2069  30S ribosomal protein S20  57.29 
 
 		 98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0603  30S ribosomal protein S20  55.1 
 
 		 98 aa  110  5e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1753  30S ribosomal protein S20  65.56 
 
 		 97 aa  110  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1780  30S ribosomal protein S20  65.56 
 
 		 97 aa  110  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16091  30S ribosomal protein S20  54.17 
 
 		 100 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1018  30S ribosomal protein S20  54.44 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.859687  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18881  30S ribosomal protein S20  54.44 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.825907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16911  30S ribosomal protein S20  53.49 
 
 		 97 aa  91.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16671  30S ribosomal protein S20  54.55 
 
 		 97 aa  90.9  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1580  30S ribosomal protein S20  52.33 
 
 		 97 aa  89.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16781  30S ribosomal protein S20  52.33 
 
 		 97 aa  90.1  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  52.87 
 
 		 88 aa  78.6  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000591631  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  54.95 
 
 		 95 aa  73.6  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0527  ribosomal protein S20  49.43 
 
 		 88 aa  72.8  0.000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  41.76 
 
 		 86 aa  68.6  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1134  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000567629  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  48.86 
 
 		 86 aa  66.6  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1106  30S ribosomal protein S20  42.71 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00644283  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  49.45 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  46.15 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 89 aa  63.5  0.0000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 94 aa  63.5  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 85 aa  63.5  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  46.74 
 
 		 88 aa  63.5  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1261  30S ribosomal protein S20  47.73 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  41.3 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1755  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00299182  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  43.96 
 
 		 86 aa  62  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  46.15 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4315  30S ribosomal protein S20  42.22 
 
 		 90 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000159944  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  43.82 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  41.76 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000562255  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  44.32 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 94 aa  60.1  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  41.76 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2835  ribosomal protein S20  43.33 
 
 		 90 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.621113 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1184  ribosomal protein S20  42.11 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0950  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0608659  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0700  ribosomal protein S20  40.66 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000536683  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_9610  predicted protein  43.21 
 
 		 84 aa  58.9  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.198308  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2223  ribosomal protein S20  47.25 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133967  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0818  30S ribosomal protein S20  41.57 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  46.43 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  45.05 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2207  ribosomal protein S20  46.59 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.437419  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0850  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000116553  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1576  ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  44.94 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  45.05 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1902  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000191113  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0947  ribosomal protein S20  40.66 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  41.3 
 
 		 89 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 86 aa  57  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  41.57 
 
 		 85 aa  57  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 		 85 aa  57  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  41.84 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1587  30S ribosomal protein S20  39.56 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  40.66 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  40.45 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1556  30S ribosomal protein S20  47.25 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  40.45 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  40.45 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  40.45 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  40.45 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  40.45 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  40.45 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  40.45 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  43.18 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  43.48 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3421  ribosomal protein S20  43.75 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144385  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  39.33 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1643  30S ribosomal protein S20  40.45 
 
 		 83 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.137149  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1678  30S ribosomal protein S20  40.45 
 
 		 83 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0126  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000563837  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2242  30S ribosomal protein S20  39.56 
 
 		 86 aa  53.5  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.636504  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  39.56 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  44.32 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3262  ribosomal protein S20  40.91 
 
 		 90 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>