128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0290 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0290  ribosomal protein S20  100 
 
 		 73 aa  140  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000431613  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1576  ribosomal protein S20  48.53 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  46.88 
 
 		 88 aa  60.1  0.000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  58.33 
 
 		 89 aa  59.3  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  53.12 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000562255  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  50.82 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  47.54 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4315  30S ribosomal protein S20  43.1 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000159944  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  42.62 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  45.16 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  45.9 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  45.9 
 
 		 89 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3191  ribosomal protein S20  44.12 
 
 		 68 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00000247507  normal  0.0669339 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  52.73 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  51.79 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  45.9 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  40.98 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  45.9 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2436  ribosomal protein S20  50 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000012228  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  44.64 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  44.64 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1013  30S ribosomal protein S20  48.21 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000773203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  41.94 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  53.7 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  45 
 
 		 87 aa  48.1  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  47.54 
 
 		 86 aa  47.4  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 92 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  44.26 
 
 		 88 aa  47.4  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000591631  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1487  30S ribosomal protein S20  47.27 
 
 		 88 aa  47  0.00008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.422821  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1667  30S ribosomal protein S20  47.27 
 
 		 88 aa  47.4  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00940932  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0947  ribosomal protein S20  43.1 
 
 		 100 aa  47  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  47.54 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0856  ribosomal protein S20  42.42 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.819382  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  49.09 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  46.77 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0490  ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 99 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1919  30S ribosomal protein S20  55 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000179184  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  48.33 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  48.33 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  48.33 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  48.33 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  48.33 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1581  30S ribosomal protein S20  45.76 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1524  30S ribosomal protein S20  45.76 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  48.33 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  48.33 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  48.33 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  45.76 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0527  ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  40.98 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  48.28 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  46.67 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3537  30S ribosomal protein S20  47.27 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  39.34 
 
 		 105 aa  44.7  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  47.27 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  47.27 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000711095  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  47.27 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000322066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  43.55 
 
 		 85 aa  44.3  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  45.9 
 
 		 85 aa  44.7  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0802  ribosomal protein S20  41.07 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0707  30S ribosomal protein S20  41.07 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  44.83 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  40 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0600  30S ribosomal protein S20  41.07 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0641  30S ribosomal protein S20  41.07 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647122  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0646  30S ribosomal protein S20  41.07 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4562  30S ribosomal protein S20  41.07 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1261  30S ribosomal protein S20  46.55 
 
 		 89 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0921  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000253205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  46.67 
 
 		 90 aa  43.5  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 162 aa  43.5  0.0009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1517  SSU ribosomal protein S20P  43.1 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.256049  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  48.15 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1096  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000700681  normal  0.0325702 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  44.26 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  41.94 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  42.86 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1520  30S ribosomal protein S20  36.23 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  42.62 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0554  ribosomal protein S20  36.67 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  44.64 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  44.64 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  46.55 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  41.82 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204572  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  44.64 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4233  ribosomal protein S20  44.64 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000543427  hitchhiker  0.000000915309 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000408096  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000294185  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0238  30S ribosomal protein S20  48.21 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00017388  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2689  30S ribosomal protein S20  42.37 
 
 		 88 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2561  30S ribosomal protein S20  42.37 
 
 		 88 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  42.37 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2181  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 97 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752642  normal  0.564535 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>