More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1919 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1919  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 99 aa  189  8e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000179184  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  50 
 
 		 88 aa  77  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  53.16 
 
 		 94 aa  76.3  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 88 aa  72  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  48.28 
 
 		 87 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  48.28 
 
 		 87 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  48.1 
 
 		 90 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 85 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3922  30S ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 88 aa  69.7  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1106  30S ribosomal protein S20  47.31 
 
 		 93 aa  68.9  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00644283  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 88 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0001  ribosomal protein S20  48.19 
 
 		 87 aa  68.2  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0152754  hitchhiker  4.7444199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4641  30S ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647122  hitchhiker  0.00990259 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4370  30S ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664055 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1184  ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  42.53 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0947  ribosomal protein S20  40.74 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1755  30S ribosomal protein S20  45.56 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00299182  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 85 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7874  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  38.95 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 86 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 86 aa  64.3  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0802  ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.939654  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4943  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 86 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 86 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 86 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 85 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0771  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0756  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000125202  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  38.78 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0947  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000396831  normal  0.19884 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  42.05 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  45.57 
 
 		 91 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  45.57 
 
 		 91 aa  61.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  44.3 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 86 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  45.57 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_002978  WD1150  30S ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  hitchhiker  0.00399464  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  43.18 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0002  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 88 aa  60.1  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000000182845  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4712  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 88 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.822452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 94 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3037  ribosomal protein S20p  39.24 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.083141  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5323  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.761405  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1383  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000140868  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0700  ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000536683  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4315  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 90 aa  60.1  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000159944  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1851  30S ribosomal protein S20  39.77 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153363  hitchhiker  0.000963738 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1454  30S ribosomal protein S20  41.89 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1521  ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000787873  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1639  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000663879  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0094  ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1576  ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1416  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.719270000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3009  30S ribosomal protein S20  40.54 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4421  30S ribosomal protein S20  40.96 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2098  30S ribosomal protein S20  40.96 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00199179  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3079  SSU ribosomal protein S20P  44.3 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0239933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4514  30S ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0919  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.459642  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2185  30S ribosomal protein S20  40.96 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0377  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2575  30S ribosomal protein S20  40.96 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1075  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0677  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0126  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2470  30S ribosomal protein S20  40.96 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0125567 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0735  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2512  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6963  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1939  30S ribosomal protein S20  40.96 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2600  30S ribosomal protein S20  40.96 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2551  30S ribosomal protein S20  40.96 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0923  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0745  30S ribosomal protein S20  40.96 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.426088 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0802  ribosomal protein S20  45.57 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0707  30S ribosomal protein S20  45.57 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  39.77 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>