More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3076 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 90 aa  171  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3191  ribosomal protein S20  88.24 
 
 		 68 aa  115  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00000247507  normal  0.0669339 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  70 
 
 		 94 aa  102  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  51.76 
 
 		 94 aa  76.6  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  49.4 
 
 		 88 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1576  ribosomal protein S20  51.85 
 
 		 89 aa  74.7  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1919  30S ribosomal protein S20  44.68 
 
 		 99 aa  74.3  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000179184  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  54.22 
 
 		 87 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  54.22 
 
 		 87 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  50.59 
 
 		 88 aa  72  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  48.75 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000562255  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  48.1 
 
 		 85 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  46.91 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  46.99 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0947  ribosomal protein S20  51.22 
 
 		 100 aa  67  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  54.43 
 
 		 84 aa  66.6  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000167926  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 86 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 86 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1587  30S ribosomal protein S20  52.94 
 
 		 88 aa  67  0.00000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 86 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  49.41 
 
 		 86 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  44.71 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 86 aa  65.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  48.81 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  46.99 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  51.11 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  49.4 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  45.78 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 88 aa  63.5  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1134  30S ribosomal protein S20  45.78 
 
 		 96 aa  63.5  0.0000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000567629  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1383  30S ribosomal protein S20  52.87 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000140868  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 86 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  46.59 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  49.37 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0818  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  48.24 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  51.95 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4514  30S ribosomal protein S20  48.78 
 
 		 89 aa  62.8  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  46.07 
 
 		 90 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  51.95 
 
 		 89 aa  62  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2941  30S ribosomal protein S20  41.11 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.205918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4205  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.885045 
 
 
-
 
NC_002936  DET1639  30S ribosomal protein S20  50.57 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000663879  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1454  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1521  ribosomal protein S20  50.57 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000787873  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1487  30S ribosomal protein S20  49.38 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.422821  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1520  30S ribosomal protein S20  43.96 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1755  30S ribosomal protein S20  44.94 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00299182  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  46.99 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  50.62 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2301  ribosomal protein S20  43.18 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1667  30S ribosomal protein S20  49.38 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00940932  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  44.05 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0001  ribosomal protein S20  45.78 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0152754  hitchhiker  4.7444199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1019  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16671  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0950  30S ribosomal protein S20  45.12 
 
 		 77 aa  60.1  0.000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0608659  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 89 aa  60.1  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  47.56 
 
 		 86 aa  60.1  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0739  30S ribosomal protein S20  44.33 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3079  SSU ribosomal protein S20P  51.85 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0239933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0802  ribosomal protein S20  49.38 
 
 		 87 aa  58.9  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.939654  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  45.78 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2185  30S ribosomal protein S20  49.4 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2098  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00199179  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  46.34 
 
 		 87 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1753  30S ribosomal protein S20  40.21 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0792  ribosomal protein S20  44.71 
 
 		 87 aa  58.9  0.00000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0700  ribosomal protein S20  43.37 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000536683  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  51.9 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16911  30S ribosomal protein S20  41.24 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1780  30S ribosomal protein S20  40.21 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0126  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000563837  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3922  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  46.25 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12640  SSU ribosomal protein S20P  45.88 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.464272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3037  ribosomal protein S20p  46.84 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.083141  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0500  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.166841  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1580  30S ribosomal protein S20  42.27 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3551  30S ribosomal protein S20  44.94 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  44.94 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16781  30S ribosomal protein S20  42.27 
 
 		 97 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4102  SSU ribosomal protein S20P  46.99 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1678  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0490  ribosomal protein S20  40.91 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0947  30S ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000396831  normal  0.19884 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2909  30S ribosomal protein S20  48.1 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0850  30S ribosomal protein S20  45.12 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000116553  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  43.62 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2817  30S ribosomal protein S20  48.1 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4315  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000159944  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3262  ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521997  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0002  30S ribosomal protein S20  46.99 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000000182845  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2181  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752642  normal  0.564535 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1583  30S ribosomal protein S20  47.5 
 
 		 83 aa  57.4  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.74402  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0527  ribosomal protein S20  44.71 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>