290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1755 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1755  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 91 aa  177  4.999999999999999e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00299182  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0126  30S ribosomal protein S20  57.14 
 
 		 95 aa  105  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000563837  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  56.82 
 
 		 96 aa  96.3  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1134  30S ribosomal protein S20  55.68 
 
 		 96 aa  92.4  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000567629  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0700  ribosomal protein S20  48.24 
 
 		 92 aa  72.4  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000536683  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  50.59 
 
 		 88 aa  70.5  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  49.41 
 
 		 87 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  49.41 
 
 		 87 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0490  ribosomal protein S20  43.16 
 
 		 99 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2941  30S ribosomal protein S20  42.55 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.205918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1919  30S ribosomal protein S20  45.56 
 
 		 99 aa  65.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000179184  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1018  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.859687  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18881  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.825907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2069  30S ribosomal protein S20  40.22 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1106  30S ribosomal protein S20  44.94 
 
 		 93 aa  63.9  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00644283  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04341  30S ribosomal protein S20  45.56 
 
 		 100 aa  63.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0739  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1019  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1639  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 88 aa  62  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000663879  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1520  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1384  ribosomal protein S20  42.7 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1521  ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 88 aa  62  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000787873  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 87 aa  62  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1383  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000140868  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0603  30S ribosomal protein S20  41.3 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000591631  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 85 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  42.05 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4205  30S ribosomal protein S20  43.33 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.885045 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 85 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0527  ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 85 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 85 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 85 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 85 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 85 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1580  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 85 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 85 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3655  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225514  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0818  30S ribosomal protein S20  47.56 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3849  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.716428  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16091  30S ribosomal protein S20  40.22 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  46.25 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16671  30S ribosomal protein S20  39.36 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0696  ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207001  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0554  ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4315  30S ribosomal protein S20  43.33 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000159944  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16911  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1753  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  43.82 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1780  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16781  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 97 aa  57  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 		 88 aa  57  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204572  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000294185  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000408096  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3274  ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  40 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  44.71 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000562255  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1096  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000700681  normal  0.0325702 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2024  ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000205272  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  41.03 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3210  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00027  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000413778  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3575  ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021535  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0025  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.87642e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  39.53 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0023  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000255802  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0027  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000024189  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0026  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000013085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3631  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000506786  normal  0.726814 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2893  30S ribosomal protein S20  39.29 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204979  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00026  hypothetical protein  40.7 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000313857  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0094  ribosomal protein S20  39.29 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0022  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000378838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>