187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1580 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1580  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 97 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16781  30S ribosomal protein S20  92.78 
 
 		 97 aa  174  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16911  30S ribosomal protein S20  90.72 
 
 		 97 aa  171  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16671  30S ribosomal protein S20  80.41 
 
 		 97 aa  150  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2069  30S ribosomal protein S20  59.57 
 
 		 98 aa  115  3e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0603  30S ribosomal protein S20  57.45 
 
 		 98 aa  110  4.0000000000000004e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1018  30S ribosomal protein S20  59.57 
 
 		 98 aa  107  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.859687  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18881  30S ribosomal protein S20  59.57 
 
 		 98 aa  107  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.825907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16091  30S ribosomal protein S20  60.44 
 
 		 100 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04341  30S ribosomal protein S20  54.26 
 
 		 100 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2941  30S ribosomal protein S20  56.7 
 
 		 112 aa  103  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.205918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0739  30S ribosomal protein S20  57.14 
 
 		 97 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1753  30S ribosomal protein S20  52.75 
 
 		 97 aa  97.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1780  30S ribosomal protein S20  52.75 
 
 		 97 aa  97.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0490  ribosomal protein S20  51.58 
 
 		 99 aa  94.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4205  30S ribosomal protein S20  54.65 
 
 		 97 aa  94  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.885045 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1019  30S ribosomal protein S20  51.61 
 
 		 116 aa  91.7  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1520  30S ribosomal protein S20  52.33 
 
 		 98 aa  89.4  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  42.57 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1134  30S ribosomal protein S20  42.57 
 
 		 96 aa  67  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000567629  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0700  ribosomal protein S20  40.21 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000536683  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 94 aa  60.5  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1755  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 91 aa  59.7  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00299182  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000591631  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0527  ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1106  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 93 aa  56.6  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00644283  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0126  30S ribosomal protein S20  35.05 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000563837  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  44.19 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0802  ribosomal protein S20  39.13 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.939654  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  36.96 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  39.13 
 
 		 91 aa  53.5  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  38 
 
 		 162 aa  53.5  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 86 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 86 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 86 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  43.33 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  38.04 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  36.05 
 
 		 88 aa  51.6  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0947  ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  39.13 
 
 		 90 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 86 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 86 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  35.87 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  41.67 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  35.87 
 
 		 86 aa  50.4  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2835  ribosomal protein S20  39.13 
 
 		 90 aa  50.8  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.621113 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 88 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  35.11 
 
 		 91 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  38.37 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  38.14 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0818  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0600  30S ribosomal protein S20  36.96 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218047  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0802  ribosomal protein S20  36.96 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  37.78 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000167926  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0707  30S ribosomal protein S20  36.96 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2188  30S ribosomal protein S20  35.87 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220995  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1846  30S ribosomal protein S20  35.87 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4562  30S ribosomal protein S20  36.96 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0641  30S ribosomal protein S20  36.96 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647122  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0577  30S ribosomal protein S20  36.96 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000729927  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0646  30S ribosomal protein S20  36.96 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1384  ribosomal protein S20  32.63 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1587  30S ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  38.89 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  33.33 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0500  30S ribosomal protein S20  31.96 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.166841  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1678  30S ribosomal protein S20  31.96 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1184  ribosomal protein S20  43.18 
 
 		 88 aa  47.8  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4514  30S ribosomal protein S20  33.33 
 
 		 89 aa  47.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  35.87 
 
 		 87 aa  47  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2024  ribosomal protein S20  36.96 
 
 		 90 aa  47  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000205272  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  31.87 
 
 		 92 aa  47  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3421  ribosomal protein S20  42.68 
 
 		 86 aa  47  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144385  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  38.89 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2211  30S ribosomal protein S20  31.52 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.829407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1432  30S ribosomal protein S20  37.8 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.195476 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2242  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.636504  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_9610  predicted protein  32.5 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.198308  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2207  ribosomal protein S20  40 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.437419  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf244  ribosomal protein S20  39.78 
 
 		 87 aa  47  0.0001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026073  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1654  ribosomal protein S20  39.58 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.158748  hitchhiker  0.00316633 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  32.63 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  37.78 
 
 		 90 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  37.78 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1013  30S ribosomal protein S20  31.52 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000773203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1851  30S ribosomal protein S20  37.78 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153363  hitchhiker  0.000963738 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3079  SSU ribosomal protein S20P  34.74 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0239933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4315  30S ribosomal protein S20  35.63 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000159944  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004422  SSU ribosomal protein S20p  33.7 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000816133  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0094  ribosomal protein S20  31.87 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0819  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1511  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>