230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_16091 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_16091  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 100 aa  199  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0603  30S ribosomal protein S20  72.45 
 
 		 98 aa  151  4e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2069  30S ribosomal protein S20  71.43 
 
 		 98 aa  147  4e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04341  30S ribosomal protein S20  71.13 
 
 		 100 aa  147  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1018  30S ribosomal protein S20  66.33 
 
 		 98 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.859687  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18881  30S ribosomal protein S20  66.33 
 
 		 98 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.825907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2941  30S ribosomal protein S20  60.47 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.205918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16911  30S ribosomal protein S20  61.54 
 
 		 97 aa  107  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16781  30S ribosomal protein S20  61.54 
 
 		 97 aa  107  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1520  30S ribosomal protein S20  54.17 
 
 		 98 aa  106  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1580  30S ribosomal protein S20  60.44 
 
 		 97 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0739  30S ribosomal protein S20  60.22 
 
 		 97 aa  103  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1019  30S ribosomal protein S20  59.3 
 
 		 116 aa  102  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4205  30S ribosomal protein S20  53.61 
 
 		 97 aa  100  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.885045 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16671  30S ribosomal protein S20  56.38 
 
 		 97 aa  100  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0490  ribosomal protein S20  56.98 
 
 		 99 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1780  30S ribosomal protein S20  54.84 
 
 		 97 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1753  30S ribosomal protein S20  54.84 
 
 		 97 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 95 aa  69.7  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0527  ribosomal protein S20  45.16 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  41.94 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000591631  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  45.16 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0700  ribosomal protein S20  43.3 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000536683  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  44.09 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  40.43 
 
 		 94 aa  61.2  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0947  ribosomal protein S20  42.7 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2835  ribosomal protein S20  48.24 
 
 		 90 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.621113 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1755  30S ribosomal protein S20  40.22 
 
 		 91 aa  59.3  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00299182  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0126  30S ribosomal protein S20  37.36 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000563837  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  39.78 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  41.94 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0094  ribosomal protein S20  40.4 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0818  30S ribosomal protein S20  40.45 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1106  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00644283  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1134  30S ribosomal protein S20  37.78 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000567629  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  41.94 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  41.94 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  41.94 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  36.78 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  40.45 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2211  30S ribosomal protein S20  38.71 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.829407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  39.78 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  41.24 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2188  30S ribosomal protein S20  41.94 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220995  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  41.86 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1846  30S ribosomal protein S20  41.94 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  40.86 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2893  30S ribosomal protein S20  38.71 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204979  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3537  30S ribosomal protein S20  37.23 
 
 		 88 aa  53.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  40.86 
 
 		 90 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf244  ribosomal protein S20  38.46 
 
 		 87 aa  53.5  0.000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026073  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0416  30S ribosomal protein S20  39.78 
 
 		 87 aa  52.8  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000443906  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  38.89 
 
 		 87 aa  53.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  44.05 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 88 aa  52.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0646  30S ribosomal protein S20  39.18 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0600  30S ribosomal protein S20  39.18 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4562  30S ribosomal protein S20  39.18 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  36.56 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  39.78 
 
 		 91 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  37.63 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  37.63 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000711095  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  37.63 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  37.63 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000322066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1096  30S ribosomal protein S20  36.56 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000700681  normal  0.0325702 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  37.63 
 
 		 88 aa  52  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0641  30S ribosomal protein S20  39.18 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647122  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  43.62 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  37.63 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000408096  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  37.63 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000294185  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  39.78 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000167926  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3079  SSU ribosomal protein S20P  39.78 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0239933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0577  30S ribosomal protein S20  38.71 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000729927  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0921  30S ribosomal protein S20  37.63 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000253205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  37.63 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204572  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  37.63 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  39.39 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 86 aa  51.2  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  38.3 
 
 		 91 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_002936  DET1639  30S ribosomal protein S20  39.77 
 
 		 88 aa  50.8  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000663879  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1521  ribosomal protein S20  39.77 
 
 		 88 aa  50.8  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000787873  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_9610  predicted protein  33.75 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.198308  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0802  ribosomal protein S20  38.71 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0707  30S ribosomal protein S20  38.71 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3421  ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144385  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4233  ribosomal protein S20  39.78 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000543427  hitchhiker  0.000000915309 
 
 
-
 
NC_002978  WD1150  30S ribosomal protein S20  40.43 
 
 		 89 aa  50.4  0.000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  hitchhiker  0.00399464  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  40.91 
 
 		 87 aa  50.8  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  40.91 
 
 		 87 aa  50.8  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  35.05 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  38.89 
 
 		 89 aa  50.1  0.000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  41.49 
 
 		 86 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12640  SSU ribosomal protein S20P  43.01 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.464272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3546  30S ribosomal protein S20  39.56 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2242  30S ribosomal protein S20  39.78 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.636504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>