240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2069 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2069  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 98 aa  198  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0603  30S ribosomal protein S20  88.78 
 
 		 98 aa  180  7e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16091  30S ribosomal protein S20  71.43 
 
 		 100 aa  147  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04341  30S ribosomal protein S20  71.13 
 
 		 100 aa  146  9e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1018  30S ribosomal protein S20  68.42 
 
 		 98 aa  138  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.859687  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18881  30S ribosomal protein S20  68.42 
 
 		 98 aa  138  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.825907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0739  30S ribosomal protein S20  61.29 
 
 		 97 aa  116  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1580  30S ribosomal protein S20  59.57 
 
 		 97 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16781  30S ribosomal protein S20  59.57 
 
 		 97 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4205  30S ribosomal protein S20  57.73 
 
 		 97 aa  114  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.885045 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0490  ribosomal protein S20  59.18 
 
 		 99 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16911  30S ribosomal protein S20  57.45 
 
 		 97 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1520  30S ribosomal protein S20  57.29 
 
 		 98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2941  30S ribosomal protein S20  60.47 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.205918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16671  30S ribosomal protein S20  55.32 
 
 		 97 aa  107  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1753  30S ribosomal protein S20  58.06 
 
 		 97 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1019  30S ribosomal protein S20  59.77 
 
 		 116 aa  105  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1780  30S ribosomal protein S20  58.06 
 
 		 97 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  49.43 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 88 aa  71.6  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000591631  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0527  ribosomal protein S20  43.96 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  44.09 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  44.09 
 
 		 86 aa  65.1  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1755  30S ribosomal protein S20  40.22 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00299182  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  46.24 
 
 		 86 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  46.24 
 
 		 86 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  46.24 
 
 		 86 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  40.43 
 
 		 96 aa  63.5  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  44.68 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  43.43 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1134  30S ribosomal protein S20  39.36 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000567629  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  42.22 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  40.23 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  43.33 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2835  ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.621113 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  48.81 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  42.22 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2188  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220995  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1846  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  41.94 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  44.09 
 
 		 86 aa  57  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  39.8 
 
 		 94 aa  57  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0947  ribosomal protein S20  39.33 
 
 		 100 aa  57  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  42.22 
 
 		 88 aa  57  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  44.05 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  39.56 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2242  30S ribosomal protein S20  45.56 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.636504  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  42.22 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3421  ribosomal protein S20  48.15 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144385  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0126  30S ribosomal protein S20  35.11 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000563837  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0416  30S ribosomal protein S20  39.18 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000443906  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0700  ribosomal protein S20  36.73 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000536683  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1184  ribosomal protein S20  41.24 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  38.54 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  40.86 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1261  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2301  ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0577  30S ribosomal protein S20  38.46 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000729927  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  37.5 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  38.71 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  40 
 
 		 89 aa  53.5  0.0000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1639  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000663879  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1521  ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000787873  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  39.56 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  39.77 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  39.77 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  39.56 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  42.22 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  39.56 
 
 		 91 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4233  ribosomal protein S20  39.56 
 
 		 87 aa  52.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000543427  hitchhiker  0.000000915309 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  38.89 
 
 		 84 aa  52  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000167926  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  41.86 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0850  30S ribosomal protein S20  39.77 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000116553  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2223  ribosomal protein S20  45.56 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133967  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  38.89 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 95 aa  51.2  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  40.45 
 
 		 107 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0582  30S ribosomal protein S20  36.56 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000160392  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00027  30S ribosomal protein S20  36.56 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000413778  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3575  ribosomal protein S20  36.56 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021535  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00026  hypothetical protein  36.56 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000313857  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0023  30S ribosomal protein S20  36.56 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000255802  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0025  30S ribosomal protein S20  36.56 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.87642e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0027  30S ribosomal protein S20  36.56 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000024189  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0026  30S ribosomal protein S20  36.56 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000013085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3631  30S ribosomal protein S20  36.56 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000506786  normal  0.726814 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0022  30S ribosomal protein S20  36.56 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000378838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1106  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00644283  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  35.48 
 
 		 88 aa  50.8  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0211  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 86 aa  50.8  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000112504  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004422  SSU ribosomal protein S20p  37.36 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000816133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>