285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_3079 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_3079  SSU ribosomal protein S20P  100 
 
 
88 aa  169  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0239933  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4641  30S ribosomal protein S20  71.26 
 
 
92 aa  117  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647122  hitchhiker  0.00990259 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4370  30S ribosomal protein S20  71.26 
 
 
92 aa  117  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664055 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6963  30S ribosomal protein S20  68.18 
 
 
88 aa  116  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0001  30S ribosomal protein S20  68.18 
 
 
88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.714217 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4890  30S ribosomal protein S20  68.18 
 
 
88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.540354  normal  0.302297 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7677  30S ribosomal protein S20  68.18 
 
 
88 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118438  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0002  30S ribosomal protein S20  68.18 
 
 
88 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000000182845  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0001  30S ribosomal protein S20  75 
 
 
88 aa  113  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000869567 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0001  30S ribosomal protein S20  65.91 
 
 
88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0001  30S ribosomal protein S20  65.91 
 
 
88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2098  30S ribosomal protein S20  65.91 
 
 
105 aa  111  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00199179  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2185  30S ribosomal protein S20  65.91 
 
 
88 aa  111  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3922  30S ribosomal protein S20  69.77 
 
 
88 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0001  ribosomal protein S20  65.52 
 
 
87 aa  110  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0152754  hitchhiker  4.7444199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1281  30S ribosomal protein S20  64.77 
 
 
88 aa  110  8.000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000755686  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4102  SSU ribosomal protein S20P  69.32 
 
 
88 aa  108  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4514  30S ribosomal protein S20  63.22 
 
 
89 aa  107  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  63.64 
 
 
88 aa  107  8.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0390  30S ribosomal protein S20  67.05 
 
 
88 aa  105  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5079  30S ribosomal protein S20  67.82 
 
 
91 aa  100  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3031  30S ribosomal protein S20  62.79 
 
 
87 aa  99.8  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.362644  normal  0.541677 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3104  ribosomal protein S20  59.09 
 
 
90 aa  97.4  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0792  ribosomal protein S20  60.92 
 
 
87 aa  94.7  3e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4421  30S ribosomal protein S20  59.3 
 
 
88 aa  94.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3802  SSU ribosomal protein S20P  57.95 
 
 
88 aa  94.4  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.042204  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3551  30S ribosomal protein S20  60.23 
 
 
89 aa  94  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4943  30S ribosomal protein S20  57.47 
 
 
88 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4712  30S ribosomal protein S20  58.14 
 
 
88 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.822452  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4212  30S ribosomal protein S20  61.36 
 
 
88 aa  92.8  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0001  30S ribosomal protein S20  65.52 
 
 
87 aa  91.7  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00020529  normal  0.124488 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5323  30S ribosomal protein S20  61.25 
 
 
88 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.761405  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4039  30S ribosomal protein S20  59.04 
 
 
88 aa  88.6  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3143  30S ribosomal protein S20  55.17 
 
 
88 aa  87.8  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7874  30S ribosomal protein S20  55.42 
 
 
88 aa  88.2  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1341  30S ribosomal protein S20  57.47 
 
 
92 aa  87  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0010  30S ribosomal protein S20  57.47 
 
 
92 aa  87  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4886  30S ribosomal protein S20  56.98 
 
 
87 aa  86.3  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.222256  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0001  30S ribosomal protein S20  59.77 
 
 
92 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.000133909  decreased coverage  0.0000000319383 
 
 
-
 
NC_002978  WD1150  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 
89 aa  82  0.000000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  hitchhiker  0.00399464  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1690  30S ribosomal protein S20  68.18 
 
 
89 aa  77  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000410806  hitchhiker  0.0000000528048 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4233  ribosomal protein S20  47.13 
 
 
87 aa  75.9  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000543427  hitchhiker  0.000000915309 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3188  30S ribosomal protein S20  54.02 
 
 
87 aa  74.7  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0921444 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2188  30S ribosomal protein S20  51.16 
 
 
91 aa  73.2  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220995  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0041  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 
95 aa  72.8  0.000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.418613  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1846  30S ribosomal protein S20  51.16 
 
 
91 aa  73.2  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3338  30S ribosomal protein S20  54.65 
 
 
86 aa  70.9  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0071  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 
95 aa  70.9  0.000000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 
92 aa  67.4  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 
87 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 
94 aa  66.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  41.38 
 
 
92 aa  66.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3546  30S ribosomal protein S20  50.59 
 
 
89 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  48.86 
 
 
88 aa  65.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000591631  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2181  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 
97 aa  65.1  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752642  normal  0.564535 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1013  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 
88 aa  65.1  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000773203  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0921  30S ribosomal protein S20  43.18 
 
 
88 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000253205  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3655  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 
87 aa  63.9  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225514  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3849  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 
87 aa  63.9  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.716428  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2893  30S ribosomal protein S20  43.18 
 
 
88 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204979  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2817  30S ribosomal protein S20  49.37 
 
 
91 aa  63.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2909  30S ribosomal protein S20  49.37 
 
 
91 aa  63.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2556  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 
88 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548445  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 
94 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 
88 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000303326  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0792  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
87 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000429038  normal  0.540603 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3037  ribosomal protein S20p  43.68 
 
 
87 aa  63.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.083141  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3462  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
87 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000449993  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1096  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 
88 aa  63.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000700681  normal  0.0325702 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 
87 aa  62.8  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3590  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
87 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000579115  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 
88 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 
88 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000711095  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 
88 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000322066  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 
88 aa  62.8  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 
88 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 
88 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000294185  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2024  ribosomal protein S20  47.73 
 
 
90 aa  62.8  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000205272  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 
87 aa  62.4  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 
88 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000408096  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 
88 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204572  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3537  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 
88 aa  61.6  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  43.68 
 
 
88 aa  61.2  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0527  ribosomal protein S20  48.86 
 
 
88 aa  61.6  0.000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1718  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 
88 aa  61.2  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  43.02 
 
 
86 aa  60.8  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2689  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 
88 aa  60.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2561  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 
88 aa  60.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 
87 aa  60.8  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 
87 aa  60.8  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2725  30S ribosomal protein S20  46.84 
 
 
92 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0313698  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1581  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
109 aa  60.5  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 
91 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3009  30S ribosomal protein S20  41.46 
 
 
106 aa  60.5  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 
91 aa  60.5  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1524  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
109 aa  60.5  0.000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 
92 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0582  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 
87 aa  60.5  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000160392  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3575  ribosomal protein S20  40.23 
 
 
87 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021535  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0023  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 
87 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000255802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>