285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3338 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3338  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 86 aa  167  6e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4886  30S ribosomal protein S20  79.07 
 
 		 87 aa  124  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.222256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  68.6 
 
 		 88 aa  124  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3188  30S ribosomal protein S20  76.74 
 
 		 87 aa  116  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0921444 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4514  30S ribosomal protein S20  62.79 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3551  30S ribosomal protein S20  61.63 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1341  30S ribosomal protein S20  67.44 
 
 		 92 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0010  30S ribosomal protein S20  67.44 
 
 		 92 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0001  ribosomal protein S20  59.3 
 
 		 87 aa  101  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0152754  hitchhiker  4.7444199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3802  SSU ribosomal protein S20P  58.14 
 
 		 88 aa  100  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.042204  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3031  30S ribosomal protein S20  66.28 
 
 		 87 aa  100  9e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.362644  normal  0.541677 
 
 
-
 
NC_004310  BR2185  30S ribosomal protein S20  59.3 
 
 		 88 aa  99.8  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0002  30S ribosomal protein S20  58.14 
 
 		 88 aa  100  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000000182845  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2098  30S ribosomal protein S20  59.3 
 
 		 105 aa  100  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00199179  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4212  30S ribosomal protein S20  65.12 
 
 		 88 aa  97.8  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3922  30S ribosomal protein S20  53.49 
 
 		 88 aa  97.1  7e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0001  30S ribosomal protein S20  67.44 
 
 		 92 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.000133909  decreased coverage  0.0000000319383 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1281  30S ribosomal protein S20  51.16 
 
 		 88 aa  94  6e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000755686  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0792  ribosomal protein S20  60 
 
 		 87 aa  93.6  9e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4370  30S ribosomal protein S20  55.81 
 
 		 92 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664055 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4641  30S ribosomal protein S20  55.81 
 
 		 92 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647122  hitchhiker  0.00990259 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4102  SSU ribosomal protein S20P  62.79 
 
 		 88 aa  89.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3079  SSU ribosomal protein S20P  54.65 
 
 		 88 aa  88.6  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0239933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6963  30S ribosomal protein S20  51.16 
 
 		 88 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7677  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 88 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118438  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4890  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 88 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.540354  normal  0.302297 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0001  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 88 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0001  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 88 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.714217 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0001  30S ribosomal protein S20  56.98 
 
 		 88 aa  81.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000869567 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0001  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 88 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0390  30S ribosomal protein S20  55.81 
 
 		 88 aa  80.1  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0001  30S ribosomal protein S20  52.33 
 
 		 87 aa  78.6  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00020529  normal  0.124488 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1487  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 88 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.422821  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1667  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 88 aa  76.3  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00940932  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3104  ribosomal protein S20  50 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4039  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 88 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3143  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 88 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 88 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4421  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 88 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5323  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 88 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.761405  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0947  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 88 aa  71.2  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000396831  normal  0.19884 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4943  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 88 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  44.19 
 
 		 88 aa  71.6  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4712  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.822452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 87 aa  70.9  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7874  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 87 aa  70.5  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0921  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 88 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000253205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 88 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 88 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000711095  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 88 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000322066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3590  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000579115  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 86 aa  70.1  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1846  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 91 aa  69.3  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0792  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000429038  normal  0.540603 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 88 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 88 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000294185  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3462  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000449993  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1096  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 88 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000700681  normal  0.0325702 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2188  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 91 aa  69.3  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220995  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 88 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000408096  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 88 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204572  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3537  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 88 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0859  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 89 aa  68.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000132311  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3849  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.716428  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5079  30S ribosomal protein S20  52.33 
 
 		 91 aa  67.8  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3655  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225514  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1013  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 88 aa  67  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000773203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0582  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000160392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0696  ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 86 aa  67  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207001  normal  0.0299142 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00027  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000413778  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3575  ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021535  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0025  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.87642e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0023  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000255802  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0026  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000013085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00026  hypothetical protein  41.86 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000313857  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2893  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204979  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0022  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000378838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0027  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000024189  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3631  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000506786  normal  0.726814 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0048  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000161385  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0048  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000398649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0047  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000090572  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  41.86 
 
 		 86 aa  65.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0478  SSU ribosomal protein S20P  43.02 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.075192  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0047  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00000872417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0047  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000542728  normal  0.0144218 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1690  30S ribosomal protein S20  56.98 
 
 		 89 aa  63.9  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000410806  hitchhiker  0.0000000528048 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0041  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.418613  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0071  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0554  ribosomal protein S20  40.96 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 86 aa  63.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 94 aa  63.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3037  ribosomal protein S20p  44.19 
 
 		 87 aa  62  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.083141  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1080  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000335633  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 91 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>